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一种基于磁性颗粒和通用连接子扩增技术的单核苷酸多态性分型方法
2009 年第67 卷 化 学 学 报 Vol. 67, 2009
第15 期, 1797～1802 ACTA CHIMICA SINICA No. 15, 1797～1802
·研究论文·
一种基于磁性颗粒和通用连接子扩增技术的单核苷酸多态性分型方法
刘洪娜a 李 松a,b 刘丽赏b 田 岚a 邓 燕a,b 李智洋a
戴亚斌a 何农跃*,a,b
(a 东南大学生物电子学国家重点实验室 南京 210096)
(b 湖南工业大学绿色包装与生物纳米技术应用湖南省重点实验室 株洲 412008)
摘要 提出了一种应用磁性颗粒和通用连接子扩增技术(Linker-PCR)的多位点单核苷酸多态性(SNP)分型方法. 该方法
首先通过酶切将样本基因组DNA 打断, 然后将通用连接子通过T4 DNA 连接酶与各个酶切片段连接, 利用生物素标记
的通用引物将样本进行全基因组扩增. 扩增后, 将生物素标记的Linker-PCR 扩增产物固定到亲合素修饰的磁性颗粒表
面, 通过与双色荧光标记的等位基因特异性探针杂交, 对待测位点进行分型. 利用该方法, 我们对10个样本MTHFR 基
因上的2 个SNP 位点进行了分型, 分型结果准确、正错配信号比大于3. 由于利用Linker-PCR 技术来实现对靶序列的
全基因组扩增, 该方法非常适用于大量样本的多基因多位点的SNP 分型研究.
关键词 连接子扩增; 磁性颗粒; 双色荧光杂交; SNP 分型
Magnetic Particle-based Single Nucleotide Polymorphism Detection
Method Using Linker-Polymerase Chain Reaction
Liu, Hongnaa Li, Songa,b Liu, Lishangb Tian, Lana Deng, Yana,b
Li, Zhiyanga Dai, Yabina He, Nongyue*,a,b
a
( State Key Laboratory of Bioelectronics, Southeast University, Nanjing 210096)
b
( Hunan Key Laboratory of Green Packaging and Application of Biological Nanotechnology , Hunan University of Technol-
ogy, Zhuzhou 412008)
Abstract An approach was presented to type multiplex single nucleotide polymorphism (SNP) by means
of magnetic particles and amplification of whole genome products using universal linker-PCR. The
linker-PCR products were captured by magnetic particl
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