基因芯片技术筛选转slnac1基因拟南芥差异表达基因-微生物学报.pdfVIP

生 物 工 程 学 报 于静洋 等/基因芯片技术筛选转SlNAC1 基因拟南芥差异表达基因 111 Chinese Journal of Biotechnology /cjbcn January 25, 2017, 33(1): 111−121 DOI: 10.13345/j.cjb.160230 ©2017 Chin J Biotech, All rights reserved • 农业生物技术 • SlNAC1 于静洋，李倩倩，焦杨，李秋莉 116081 , , , . SlNAC1 . , 2017, 33(1): 111–121. Yu JY, Li QQ, Jiao Y, et al. Gene chip analysis of differentially expressed genes in transgenic SlNAC1 Arabidopsis . Chin J Biotech, 2017, 33(1): 111–121. 摘 要: 研究已表明植物特有的一些NAC (NAM, ATAF1/2, CUC2) 转录因子可提高植物抗逆性，利用基因芯 片技术筛选转SlNAC1 基因拟南芥与野生型拟南芥间差异表达基因，能够为研究转基因拟南芥非生物胁迫抗性 相关基因提供依据。结果显示，在转SlNAC1 基因拟南芥43 604 个基因中有3 046 个差异表达2 倍以上的基因。 对差异表达 5 倍以上基因经过 GO 富集度统计学分析表明，细胞组分相关基因占33.05%；分子功能相关基因 占33.95%；生物学过程相关基因占33.00% 。对差异表达2 倍以上基因进行KEGG 信号通路分析，结果表明有 2 431 个基因涉及到88 个不同的信号通路。通过筛选获得转基因拟南芥非生物胁迫抗性相关候选基因，为后续 研究NAC 转录因子的下游基因及其调控网络的构建提供方向和理论支撑。 : 差异表达，转基因，非生物胁迫抗性，转录因子，GO 分析，KEGG Gene chip analysis of differentially expressed genes in transgenic SlNAC1 Arabidopsis Jingyang Yu, Qianqian Li, Yang Jiao, and Qiuli Li College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, Liaoning, China Abstract: Studies have shown that some plant-specific NAC (NAM, ATAF1/2, CUC2) transcription factors may increase plants resistance to stress. We screened the genes differentially expressed in transgenic SlNAC1 Arabidopsis compared to the wild type by cDNA microarry, to provide scientific basis for studying the genes related to abiotic stress responses in Received: June 14, 2016; Accepted: September 19, 2016 Supported by: National Natural Science Fundation of China (No., Scientific