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论著 ZHYF-2014-0710-00827 占5面 关键词4 已核 参考文献16已核 英摘未核 图2 已核
中国八省份2006—2014年肠致病性大肠杆菌分离株的多位点序列
分型分析
李红 白向宁 赵爱兰 熊衍文 许彦梅
DOI:10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2015.04.0
基金项目:国家自然科学基金
作者单位:100035 北京积水潭医院感染控制科(李红);中国疾病预防控制中心
传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 (白向宁、赵爱兰、
熊衍文、许彦梅)
Email xyanmei2006@126.com
通信作者:许彦梅, :
2006 2014 8
【摘要】目的 了解 — 年分离自我国 个省份不同宿主的肠致病性大
肠杆菌 (EPE )的分子分型特征。方法 于2006—2014年,从我国8个省份的腹泻
病例、动物粪便、食品中分离大肠杆菌菌株,根据分离年代、地点、宿主来源以及
PFGE 149 EPE
带型特点,选取其中的 株 分离株。选择大肠杆菌多位点序列分型
(MLST)数据库提供的7个管家基因,对149株EPE 分离株进行MLST分析,
ST 56 SeqManII MEGA5.05 eBURSTV3
确定菌株序列型 ( )共 种。采用 、 、 等软件,
对MLST数据库中包含的 137种ST型别的243株EPF 菌株以及本研究56种ST
型别的149株EPE 分离株进行遗传进化分析。结果 56种ST型别中,ST-40型
菌株比例较高,占 12.8% (19/149),为优势型别菌株;新ST型别有19种,7个
6 adk fumC gyrB icd mdh purA 11
管家基因中有 个 ( 、 、 、 、 和 )检测到 种新等位基因
型。同时包括腹泻病例和动物粪便来源的菌株的ST型别为6种,其EPE 类型均
EPE aEPE ST 2
为非典型 ( );同时包括腹泻病例和食品来源的菌株的 型别为 种,
其EPE 类型均为非典型EPE (aEPE )。eBURST聚类分析显示,193种ST型
别中,173种ST型别形成了5个主要ST序列群,分别为ST -29、ST -10、ST -20、
ST -28 ST -517 20 ST
和 ,其余 种 型别菌株散在分布于其他克隆群中或为单例。
8 EPE ST
结论 我国 个省份的 分离株的 型别呈高度多样性,与腹泻患者分离株存
在相同ST型的动物粪便和食品分离株的EPE 类型均为aEPE 。
【关键词】肠致病性大肠杆菌;多基因座顺序分型;分子分型
Multilocus sequencetyping analysisof enteropathogenicEscherichia coli isolatesin
China LiHong ,BaiXiangning,ZhaoAilan,Xiong Yanwen,Xu Yanmei.BeijingJishuitan* *
Hospital,Beijing100035,China
Correspondingauthor:Xu Yanmei,Email:xyanmei2006@126.com
Abstract ObjectsTheobjectivewastoinvestigatethemoleculartypingfeature
【
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