牡丹5个管家基因的克隆及其在系统进化分析中的应用-园艺学报.pdfVIP

园艺学报，2016 ，43 (2) ：307 –319. Acta Horticulturae Sinica doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0758；http ：//www. ahs. ac. cn 307 牡丹 5 个管家基因的克隆及其在系统进化分析 中的应用 1,2 1,* 1 1 1 1 3,** 杨 勇 ，王顺利 ，薛璟祺 ，任秀霞 ，李丹丹 ，杨若雯 ，曾秀丽 ， 张秀新1,** 1 2 （中国农业科学院蔬菜花卉研究所，农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100081 ； 四川农业大学 3 玉米研究所，农业部西南玉米生物学与遗传育种重点实验室，成都 611130 ； 西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所， 拉萨 850030 ） 摘 要：利用 RT-PCR 技术从牡丹组 7 个野生种和 1 个栽培种中分别克隆得到泛素延伸蛋白基因 （ubiquitin ，UBI）、素环蛋白基因（cyclophilin ，CYP ）、肌动蛋白基因（Actin ）、葡萄糖六磷酸脱氢酶基 因（glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase ，G6PD）和 β–微管蛋白基因（beta-tubulin ，TUB）等5 个管家 基因的编码序列（coding sequence，CDS ）。序列比对分析发现，5 个管家基因序列均相对保守，其在牡丹 7 个野生种和 1 个栽培种中的保守性在 99.04% ~ 99.69% 。利用5 个管家基因分别构建了其在牡丹组 8 份 材料中的系统进化树。5 个系统进化树均将 8 份材料分成两组，即革质花盘亚组和肉质花盘亚组；由于 5 个管家基因核苷酸序列各自的保守性不同，在区分亚组成员间略有差异。综合分析 5 个管家基因构建的 系统进化树可知，杨山牡丹（Paeonia ostii ）和栽培牡丹（P. suffruticosa ‘Luoyanghong ’）常聚为一支， 二者亲缘关系较近，因而推测杨山牡丹可能参与了栽培牡丹的形成；紫斑牡丹（P. rockii ）和四川牡丹（P. decomposita ）一直聚为一支，推测二者亲缘关系较近；黄牡丹（P. lutea ）和紫牡丹（P. delavayi ）一直聚 为一支，推测这二者亲缘关系较近。狭叶牡丹（P. potaninii ）与黄牡丹和紫牡丹分化较早，结合前人研究 结果建议将狭叶牡丹作为一个独立的种。 关键词：牡丹；管家基因；系统发生；进化 中图分类号：S 685.11 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2016 ）02-0307-13 Cloning of Five House-keeping Genes and Their Application in Phylogenetic Analysis of Tree Peony 1,2 1,* 1 1 1 1 YANG Yong ，WANG Shun-li ，XUE Jing-qi ，REN Xiu-xia ，LI Dan-dan ，YANG Ruo-wen ，ZENG Xiu-li3,** ，and ZHANG Xiu-xin1,** 1 （Key