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科技
science topics 专题
利用基因芯片剖析水稻根部
系统－发育与生理
第九届国际水稻功能基因体研讨会将于 11 题。此篇研究以讯号超过 50 且有出现在任三片数
月 7‐9 日于台湾中研院举行，在全球稻米出口量最 据中就保留该基因，为以取最多基因数为前提下进
大国－泰国遭逢半世纪以来最严重的水患之际，粮 行数据分析。
食危机已不再是竦动的标题，而是人人必须正视的
议题。在七月号的华联快讯中，我们曾介绍日本农
业研究中心以实地探讨农田中的水稻的基因表达
情形，建立一个 RiceXPro (http://ricexpro.dna.affrc.g
o.jp/) 的网站。在 2011 年九月该团队发表了最新
研究，以基因芯片为工具进行根部的 Genome‐wide
transcriptome 研究，根部是第二次绿色革命中的关
键角色，此大型研究可协助学者更了解根在发育与
生理功能的角色。华联在 2011 年亦推出水稻基因
芯片与模式植物的 miRNA 芯片，旨在协助水稻专
家们进行大规模的实验，探讨逆境生理的调控机制
图一
与辅助寻找抗逆境的生物标志。
样品部位描述
(a) 冠状根分为 8 区代表不同发育时期 (R0-R7) 。 LR, lateral
root; LRP, lateral root primordium。
实验设计与数据质量 (b) 冠状根在 R2R3 与 R7 的横切面图，代表取样部位的组织
日本团队利用 laser microdissection 技术，将
形态，分别为 EpiExo (epidermis/exodermis/sclerenchyma) 、
冠状根 (crown root) 自纵轴分成8 区 (R0‐R7)、横
Cortex (cortex with approximately three layers) 与 EndStele
轴分成3 区 (EpiExo、Cortex 与 EndStele) 进行特定
(endodermis/pericycle/stele)。
组织取样，其中仅在 R2R3 与 R7 两个发育时期有
取 EpiExo、Cortex 与 EndStele 等部位 (见图一)1 ， 华联生技服务报告的 PCA (principle
而 R7 之 Cortex 区域因为富含 aerenchyma component analysis) 可协助客户依据样品间的距离
(non‐living cells)，而未进行基因芯片实验。除了 R7
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