真核生物启动子研究概述-生物技术进展.pdfVIP

生物技术进展 ２０１４年　 第４卷　 第３期　 １５８～１６４ 进展评述 Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ　 ＩＳＳＮ２０９５⁃２３４１ Ｒｅｖｉｅｗｓ 真核生物启动子研究概述 ∗ ∗ 李圣彦，　 郎志宏 ，　 黄大昉 中国农业科学院生物技术研究所，农业部农业基因组学重点实验室（北京），北京 １０００８１ 摘　 要： 启动子是调控基因表达的重要基因元件，它的调控作用是多层次多因素共同作用的结果。 通过启动子的调控 能够控制基因表达的水平、部位及方式。 深入研究启动子对于了解生物的生长发育、防御系统、疾病等都有非常重要的 意义。 本文综述了启动子克隆、生物信息学分析和预测的方法，比较了两种启动子分析方法，介绍了启动子甲基化、多态 性和合成启动子的研究进展，以期能够为启动子的研究提供参考。 关键词： 启动子；克隆；生物信息学；转录因子；甲基化；多态性 ＤＯＩ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．２０９５⁃２３４１．２０１４．０３．０２ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｏｎ Ｅｕｋａｒｙｏｔｉｃ Ｐｒｏｍｏｔｅｒ ∗ ∗ ＬＩ Ｓｈｅｎｇ⁃ｙａｎ，ＬＡＮＧＺｈｉ⁃ｈｏｎｇ ，ＨＵＡＮＧ Ｄａ⁃ｆａｎｇ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ， Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｎｅｃｅｓ； Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ （Ｂｅｉｊｉｎｇ）， Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８１，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｐｒｏｍｏｔｅｒ ｉｓ ａｎ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｅｌｅｍｅｎｔ ｉｎ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｔｈｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｒｏｌｅ ｏｆ ｐｒｏｍｏｔｅｒ ｉｓ ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｏｆ ａ ｍｕｌｔｉ⁃ｌｅｖｅｌ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ ｏｆ ｍｕｌｔｉｐｌｅｆａｃｔｏｒｓ． Ｔｈｅ ｌｅｖｅｌ，ｌｏｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｍａｎｎｅｒ ｏｆ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｒｅ ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｂｙ ｔｈｅ ｐｒｏｍｏｔｅｒ，ｓｏ ｄｅｅｐｌｙ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｐｒｏｍｏｔｅｒ ｉｓ ｏｆ ｇｒｅａｔ ｉｍｐｏｒｔａｎｃｅ ｆｏｒ ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｇｒｏｗｔｈ， ｄｅｆｅｎｓｅ ｓｙｓｔｅｍ ａｎｄ ｄｉｓｅａｓｅ． Ｔｈｉｓ ｐａｐｅｒ ｒｅｖｉｅｗｓｔｈｅ ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ ｐｒｏｍｏｔｅｒ ｃｌｏｎｉｎｇ，ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄｆｏｒｅｃａｓｔｉｎｇ ｏｆ ｐｒｏｍｏｔｅｒ，ｃｏｍｐａｒｅｓ ｔｗｏ ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ ｐｒｏｍｏｔｅｒ ａｎａｌｙｓｉｓ，ｉｎｔｒｏｄｕｃｅｓ ｔｈｅ ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｏｆ ｐｒｏｍｏｔｅｒ ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ｓｏ ａｓ ｔｏ ｐｒｏｖｉｄｅ ａ ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ｆｏｒ ｆｕｒｔｈｅｒ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｐｒｏｍｏｔｅｒｓ． Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：ｐｒｏｍｏｔｅｒ；ｃｌｏｎｅ；ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ；ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ；ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ；ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ［１］ 　 　 启动子是指ＲＮＡ聚合酶识别、结合和启始转 该方法最早应用于大肠杆菌 ，后广泛应用于果 录的一段ＤＮＡ序列，通常位于基因上游。 启动子 ［２］ ［３］ ［４］