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生物大分子相互作用 与分子识别 2015-10  生物大分子之间特异性地、可逆解 离地形成复合物的能力是生命活动 的基础，这种特异性的、可逆的相 互作用被称为生物分子的识别。 生物分子之间的分子识别  一 生物大分子相互作用的过程  1 扩散  两分子在结合之前依靠热运动而彼此靠近。热运动引起 分子从原有位点移动，到达邻近的新位置，这称为扩散。  2 运动  广义上讲，分子运动可以分为3类：①分子从一个位置移 到另一位置的移位运动；②振动；③旋转。所有这些运动 形式对相互作用的大分子表面的接近都是极为重要的，移 位运动所产生的扩散碰撞速率与扩散分子的浓度成正比。  3 分子间的相互作用与识别  蛋白质、核酸、多糖之间的相互作用和识别都是通过大 分子各自特定部位高级结构的匹配、契合来实现的。 二、分子识别的特性  1.作用的专一性  生物大分子在机体内行使各种各样的 功能，参与了形形色色的反应，它们行 使的功能和参与的反应都具有高度专一 性。这种专一性也是药物分子与生物大 分子相互作用并产生某专一性生物效应 的理论基础。不同生物大分子之间相互 作用专一性的基本原理是相同的。  蛋白质与特异DNA序列的选择性结合主要依赖两种类 型的相互作用提供结合能。第一类相互作用是多肽链 与碱基对之间的直接接触，第二类相互作用是多肽链 中的碱性氨基酸残基与戊糖骨架之间的电荷联系。  多肽链对特异DNA序列的识别与结合可以通过限定结 构进行，结构生物学家利用多种先进分析技术，通过 DNA-蛋白质相互作用分析，已经鉴定出多种结合特异 DNA序列的蛋白质结构元件，其中最常见的是存在于 原核、真核调节蛋白中的HTH （螺旋-转角-螺旋模体）， DNA、RNA结合蛋白中的锌指结构。目前已知的蛋白 质识别基元大多数是与DNA大沟接触。 Lac阻遏蛋白-DNA的相互作用  2.分子识别过程中高级结构的变化  生物大分子的高层次结构是靠分子内非共价 键来维系的，这些非共价键使分子中很多基团 不能自由转动；而一些在表面的基团因不参与 非共价键的形成，自由度较大，可处于不停的 热运动中。有些非共价键可因外来分子或周围 环境的影响而改变，从而使生物高分子局部空 间构象有所改变。  3.分子识别过程的连续性与协调性  生物体内的成千上万种生物大分子，在生命 活动过程中是相互配合，又彼此协调统一的。 生物体内存在着许多条 “流水作业线”，每条 “作业线”都由多个生物大分子组成，它们各 司其职，又相互配合，共同完成某一反应。如 生物体内物质的代谢过程，在这类体系中，不 仅生产过程连续不断，而且生产速度越来越快， 整个过程中有逐级放大作用。 分子生物学研究的重要领域  遗传中心法则  基因表达调控  细胞信号转导 单个基因 单个细胞 Genome (cell’s repertoire of DNA) Transcriptome (cell’s repertoire of RNA transcripts) Proteome