确定化学结构的微机检索系统.pdfVIP

确定纯学建擒的徽撬捡索系统。 陈维明孙传游朱翠娣徐舯波 (中溜科学院上海有机化学研究所，上海抽0∞2) 摘要赡定化学籍构检索是记学信息检索中最重要和应建最广的磷能。本文 报道一种具有全结构检索、模糊结构检索和结构属性检索功能的微机确定化学 结构检索系统，系统可吼自动识别和处理确定化学结构在互变异构和势香环双 键位置表母土鳕薮义．在嬲夸药耱和是然产确确定托擎黠热规模时，在奔 111500徽枫上全蛄豌硷索速度为0．8秽。 美键词确定化学结构检索全结构检索模糊结构检索结构属性检索 由于化龠物熬名拣和分予式等性质都誉唯一，让学结构成为化台物的唯～标识。燕翻 纯学文臻社祷讫台褥按照魄学瑟梅连器登蒙，形成著名豹纯食糖CAS登最弩+嚣霸钝拳结 构或CAS登霖警，相关钯攀数据和信惠可叛建立相互闯的联系和参照。褰现信怠共事和敬 据组装。化学信息系统如聚具有化学结构处理能力将实现信息登录，并大大增强系统的饺 索能力。化学结构处理能力和检索功能成为衡量化学信息系统功能和脯擞的重要指标。根 撵羹擒接述方式斡不彝，毒乏学结籀胃器摇器是否氢舍不确定熬酝鼗薹R分袋族蛙毽学壤构 帮确定纯学缱籀两夫类，箕孛不包含取代基R雏碡定豫攀绻梅应瑟最饕逾，鞋嚣鏊雨卦绝 大部分化学f嚣息系统或软件挺供的化学结构检索都是指确寇化学结构。 VAX 我们曾缝于1987年完戚了基于DEC11／780计算机和RMS文件臀理系统的国内髂 一个确定亿学续鞫捡囊系缆锵0c—sⅡ拶，提供确定化学结拇豹全结掏稿子结构捡索功 嚣，经过功煞扩曩秘避一步鳇完善，这一系统鹱舞毪台钫命名与臻鞫数擦瘁掰，T-1991年 通过中国科学院科学数据撵工程验收。成为科学数据库张学专韭数据瘩中进行他台韵爨录 和连接相燕化学信息的关键予库，登录的化台物已经超i蜘70000个。随蒋计算机硬件和成 用环境的炎他，微机化和上网成为最基本购需求，化学结构数据库和检索系统向微机芹订 窘∞so瞒∞，端基霹薛凌转移藏蠹必蒸豹遵路。确定拖攀终褥巍疆毂捡煮累绫是在继承袋米 纯学结拇簸理慝路，采援荚系数据痒搂黧，使蘑最薪技术更耨了霓乎垒鼯算法联建立鹃凝 系统，扩展了确定化学的精构检索能力，大大提高了检索效率。 一、确懋化学结构检索 建学蠢￡蔚熬惹裒营遮爱耀黪飘库誊靖构表示莛一静嚣黪豪逮，话黧槐冤法壹接谖掰耩 处理。尽管化学结构可戳镘用片断码翻羊珏跤性标识硝形成攒似字符串的文字表示，毽蹙出 于化学结构检索涉及的精确I￡较必须在原予级上进行，禚检索系统内部髓少保留一份撼乎 骧子的化学结构袭示。基于这一考虑，几乎所有化学结构处理系统都使用基于图论精确剥 漂子夔蓬羧表液透谗秀纯孥结祷蠹蒸表述方式，著蒋其捧为与强赛翁数据交换藉；难酮。 ’茸家自然科举纂金批准姿勘项秘 -99- 相对于其他化学性质，化学结构表示是唯一的。但是由于经典化学结构理论的局限， 部分化合物存在一种以上的合理化学结构表示，导致化学结构表述上的歧义。在确定结构 描述中，最常见的结构表述歧义包括互变异构、芳香键(共轭Ⅱ键)共振、共价和离子键 表示、氨基酸酸式和碱式表示等。这些结构歧义将严重影响化学结构的检索，为此需要将 提问化学结构和库中化学结构事先转换成规范的结构表述。本系统使用的互变异构和芳香 键规范方法是在原有算法上的更新[71，方法接近美国化学文摘社的标准并记录了移动质点 的信息，可以提供由规范结构复原到原结构所需的信息。 与常见文本型信息的直接检索不同，化学结构的检索需要通过两步实现，即针对大量 库结构的快速索引检索和针对候选库结构的结构精确比较。前者要求快速和不漏，后者要 求准确可靠。本系统考虑了确定化学结构已知的检索不变量嘲，如分子式、键类型计数， 原子连接度计数、环系数币I最小环最小集91等。由这些检索不变量组成的全结构索引具有 较强的结构分辨能力。’已知的索引码重码现象由取代基位置和功能团(如双键)位置差异 引起。本系统使用的结构比较方法通过色性比较、原子邻域比较快速删除相似结构，然后 进行提问结构和库结构间的原子指派，具有很高的效率。 为了实现确定化学结构的检索功能，确定化学结构微机