南方根结线虫延长因子2基因cdna全长克隆和序列分析-中国农学通报.pdfVIP

中国农学通报 2011,27(01):223-228 Chinese Agricultural Science Bulletin 南方根结线虫延长因子2基因cDNA全长克隆和序列分析 黎娟华，赵平娟，孙海彦，彭明 （中国热带农业科学院热带生物技术研究所，海口571101） 摘 要：以南方根结线虫为材料，根据同源序列法分别进行3末端和5末端的RACE ，获得延长因子基因 2 cDNA 全长。此cDNA 全长序列为2434 bp ，包括2334 bp 的完整ORF ，编码一含777 个氨基酸的多 肽。该基因命名为Mi-eft2 ，其推导蛋白MI-EFT2 的编码氨基酸与秀丽隐杆线虫的Ce-eft 1，Ce-eft2 ， Ce-eft3 ，Ce-eft4 基因的推导蛋白的同源性分别为26.7% 、86.9% 、13.8%和8.9% 。蛋白功能分类预测 MI-EFT2 是一种在蛋白质延长过程中起作用的GTP 水解酶，与真核生物的延长因子2 功能相同。 关键词：南方根结线虫；延长因子2 ；RACE ；蛋白功能预测 中图分类号：S432.45 文献标志码：A 论文编号：2010-2010 CloningandSequenceAnalysisofFull-lengthcDNAofElongationFactor2GeneofMeloidogyn incognita Li Juannhua, Zhao pingjuan, Sun haiyan, Peng Ming (Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology , Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou 571101) Abstract: The full-length cDNA sequence of elongation factor 2 (Mi-eft2) was obtained by RT-PCR and RACE from Meloidogyne incognita. It consisted of 2434 nucleotides, and encoded 777 amino acids. The amino acid sequence of deduced protein MI-EFT2 was 26.7%, 86.9 %, 13.8% and 8.9% identical with the deduced proteins of Ce-eft 1, Ce-eft2, Ce-eft3 and Ce-eft4 from Caenorhabditis elegans respectively. Protein function prediction of MI-EFT2 suggested that it was a GTPase just like the eukaryotic elongation factor EF2, involved in the protein elongation process. Keywords:Meloidogyne incognita; elongation factor 2; RACE; protein function prediction [2-3] 0 引言 植物 。植物本身的抗线虫基因的研究和利用RNAi 南方根结线虫（Meloidogyne incognita）是重要的 技术研究线虫本身的基因，都是目前国内外较热的研 植物寄生线虫之一，寄主广泛，在中国特别是南方地区 究领域。利用基