圆弧青霉脂肪酶基因序列的生物信息学分析-食品与生物技术学报.pdfVIP

第29 卷第4 期 食 品 与生 物 技 术学 报 V ol. 29 N o. 4 2010 年7 月 Journal of Food Science and Biotechnology Jul . 20 10 : 167 3- 1689( 20 10) 04- 0602- 07 圆弧青霉脂肪酶基因序列的生物信息学分析 1 1 * 2 张慧敏 , 李剑芳 , 邬敏辰 ( 1. 江南大学食品学院, 江苏无锡214122 2. 江南大学 医药学院, 江苏无锡214 122) : 从圆弧青霉P G37 中克隆了碱性脂肪酶( L ip I) 因, 并采用生物信息学分析了PG 37 L ip I 因携带的遗传信息序列分析结果表明: L ip I DN A 序列全长 1 4 80 bp, 不存在重复序列, 含有 5 个内含子, 5 端存在T A T A box 和多个转录因子结合位点 cDN A 序列全长 1 12 8 bp , 包含了转 录起始位点5 和3 非编码区及858 bp 的开放阅读框架 L ip I 编码区对T G CGA CT T CCA C A A G A A C 和T A C 这7 种密码子使用频率最高 比对L ip I 因与P ich ia p astoris 因组中的密 码子使用频率, 其中有21 个密码子使用频率的比值相差较大 : 生物信息学 圆弧青霉PG 37 碱性脂肪酶 基 序列 : Q 811. 4 : A Bioinformatics Analysis on the Sequence of Lipase Gene from Penicillium cy clop ium 1 1 * 2 ZH A N G H ui- min , L I J ian-f ang , W U Min- chen ( 1. Schoo l of Fo od Science and T echnolog y, Jiang nan U niver sity, Wuxi 2 14 122, China 2 . Scho ol o f M edicine and Ph ar maceutics, J iangnan U niver sity, Wux i 2141224, China) Abstract:T he g ene encoding alkaline lipase ( L ip I) is cloned f rom P en ic il l ium cy c lop i um PG 37 and t he genet ic inf orm at ion is analy zed by bio inf ormat ic t ool. Sequence analy sis show ed t hat L ip I D N A is 1480 bp long w it h no rep eat sequ ence and f ive int ron s, and t here is a T A T A box and several t ran script i