计算机辅助设计抗mrsa耐药基因mecr1的1023型脱氧核酶.pdfVIP

学 报 ３８０ ＪｏｕｒｎａｌｏｆＣｈｉｎａＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　２０１０，４１（４）：３８０－３８４ 计算机辅助设计抗ＭＲＳＡ耐药基因ｍｅｃＲ１的 １０２３型脱氧核酶   周　颖，薛小燕，白　卉，马　雪，侯　征 ，罗晓星 （第四军医大学药学系药理学教研室，西安７１００３２） 摘　要　应用ＰｒｉｍｅｒＰｒｅｍｉｅｒ５０和ＲＮＡｓｔｒｕｃｔｕｒｅ４６两种软件设计和筛选有效抗ｍｅｃＲ１的１０２３型脱氧核酶（ＤＲｚ）， 采用电转化的方法将其导入细菌体内，实时ＰＣＲ的方法定量检测其对ｍｅｃＲ１转录的影响，并通过平板克隆形成实验观察脱 氧核酶抑制细菌生长的情况。结果表明，计算机辅助设计合成的５条抗ＭＲＳＡ耐药调控基因ｍｅｃＲ１的１０２３型脱氧核酶， 它们能不同程度的降低ｍｅｃＲ１的转录水平，有效抑制临床耐药菌ＭＲＳＡ０８０３０９的生长，其中ＤＲｚ６抑制效果最显著。说明 联合应用这两种计算机软件设计抗ｍｅｃＲ１的１０２３型脱氧核酶，是一种经济实用而有效的方法，能够大大缩短有效反义药 物的筛选时间。 关键词　１０２３型脱氧核酶；耐甲氧西林金黄色葡萄球菌；ｍｅｃＲ１基因；计算机辅助设计 中图分类号　Ｒ３７８１１　　文献标识码　Ａ　　文章编号　１０００－５０４８（２０１０）０４－０３８０－０５ Ｃｏｍｐｕｔｅｒａｉｄｅｄｄｅｓｉｇｎｏｆｔｈｅ１０２３ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｚｙｍｅｔａｒｇｅｔｉｎｇｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｇｅｎｅ ｍｅｃＲ１   ＺＨＯＵＹｉｎｇ牞ＸＵＥＸｉａｏｙａｎ牞ＢＡＩＨｕｉ牞ＭＡＸｕｅ牞ＨＯＵＺｈｅｎｇ牞ＬＵＯＸｉａｏｘｉｎｇ ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＰｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ牞ＦｏｕｒｔｈＭｉｌｉｔａｒｙＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ牞Ｘｉ′ａｎ７１００３２牞Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ　ＴｈｅｐｕｒｐｏｓｅｏｆｔｈｉｓｓｔｕｄｙｗａｓｔｏｅｘｐｌｏｉｔｔｈｅｐｏｔｅｎｔｉａｌｏｆＰｒｉｍｅｒＰｒｅｍｉｅｒ５０ａｎｄＲＮＡｓｔｒｕｃｔｕｒｅ４６ｉｎ ｔｈｅｄｅｓｉｇｎａｎｄｓｅｌｅｃｔｉｏｎｏｆｅｆｆｅｃｔｉｖｅ１０２３ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｚｙｍｅ牗ＤＲｚ牘ｔａｒｇｅｔｉｎｇｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｇｅｎｅｍｅｃＲ１Ｆｉｖｅｄｅｓｉｇｎｅｄ ａｎｄｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｄａｎｔｉｍｅｃＲ１１０２３ＤＲｚｓｅｑｕｅｎｃｅｓｗｅｒｅｉｎｔｒｏｄｕｃｅｄｉｎｔｏｔｈｅＭＲＳＡｓｔｒａｉｎｂｙｅｌｅｃｔｒｏｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｉｎｖｉｖｏＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｏｆｍｅｃＲ１ｗａｓａｎａｌｙｚｅｄｂｙｒｅａｌｔｉｍｅｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＰＣＲＴｈｅｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙｅｆｆｅｃｔｓｏｆＤＲｚｓｏｎｔｈｅ ｂａｃｔｅｒｉａｌｇｒｏｗｔｈｗｅｒｅｅｖａｌｕａｔｅｄｂａｓｅｄｏｎｔｈｅｐｌａｔｅｃｌｏｎｉｎｇｆｏｒｍａｔｉｏｎＩｔｗａｓｆｏｕｎｄｔｈａｔｔｈｅｆｉｖｅａｎｔｉｍｅｃＲ１１０２３ ＤＲｚｓｅｑｕｅｎｃｅｓｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙｌｏｗｅｒｅｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｏｆｍｅｃＲ１ａｎｄｉｎｈｉｂｉｔｅｄｔｈｅｇｒｏｗｔｈｏｆｃｌｉｎｉｃａｌｄｒｕｇｒｅｓｉｓｔａｎｔ ＭＲＳＡ０８０３０９牞ｗｉｔｈＤＲｚ６ｈａｖｉｎｇｔｈｅｍｏｓｔｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙｅｆｆｅｃｔＴｈｅｒｅｆｏｒｅ牞ｔｈｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｔｗｏｃｏｍ ｐｕｔｅｒｓｏｆｔｗａｒｅｓｉｓａｎｅｃｏｎｏｍｉｃａｌ牞ｐｒａｃｔｉｃａｌａｎｄｅｆｆｅｃｔｉｖｅａｐｐｒｏａｃｈｉｎｔｈｅｄｅｓｉｇｎｏｆａｎｔｉｍｅｃＲ１ＤＲｚ牞ａｎｄｃｏｕｌｄ ｇｒｅａｔｌｙｒｅｄｕｃｅｔｈｅｓｃｒｅｅｎｉｎｇｔｉｍｅｏｆａｎｔｉｓｅｎｓｅｄｒｕｇｓ Ｋｅｙｗｏｒｄｓ　 １０２３ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｚｙｍｅ牷ｍｅｔｈｉｃｉｌｌｉｎｒｅｓｉｓｔａｎｔＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓａｕｒｅｕｓ牗ＭＲＳＡ牘牷ｍｅｃＲ１牷ｃｏｍｐｕｔｅｒ ａｉｄｅｄｄｅ