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SDS—PAGE凝胶电泳(细致分析)

SDS电泳的基础原理和实验步骤名称:SDS(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis)十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳原理:此项技术的原理,是根据样品中蛋白质分子量大小的不同,使其在电泳胶中分离。不同的蛋白质在不同的pH值下表现出不同的电荷,同时蛋白质具有不同的大小和形状。为了使蛋白在电泳中的迁移率只与分子量有关,我们在上样前,通常会进行一些处理。上样缓冲液由Tris-HCl(pH6.8)?、甘油,10%SDS、β-巯基乙醇、0.1%溴酚蓝以及蒸馏水组成。其各自的作用如下述:SDS 即十二烷基硫酸钠,是一种阴离子表面活性剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级和三级结构; β-巯基乙醇是强还原剂,它可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键。由于SDS和巯基乙醇的作用,蛋白质完全变性和解聚,解离成亚基或者单个肽链,因此测定结果只是亚基或者单个肽链的分子量。同时,SDS与蛋白质结合引起蛋白质的构象改变,形成长椭圆棒状,不同蛋白质短轴长度都一样,长轴随蛋白分子量不同而不同,这样就消除了性状的影响。另外,解聚后的氨基酸侧链和SDS结合成蛋白- SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电荷差异和结构差异。甘油用以增大样品液密度,使加样时样品溶液可以快速沉入样品凹槽底部。样品处理液中通常还加入溴酚蓝染料,用于监控整个电泳过程。SDS一般采用的是不连续缓冲系统,与连续缓冲系统相比,能够有较高的分辨率。浓缩胶的作用是有堆积作用,凝胶浓度较小,孔径较大,把较稀的样品加在浓缩胶上,经过大孔径凝胶的迁移作用而被浓缩至一个狭窄的区带。样品液和浓缩胶中Tris-HCl均为pH6.8,上下槽缓冲液含Tris-甘氨酸(pH8.3),分离胶含Tris-HCl(Ph8.8).电泳启动时,蛋白样品处于pH6.8 的上层,pH8.8 的分离胶层在下层,上槽为负极,下槽为正极。出现了 pH 不连续和胶孔径大小不连续:启动时Clˉ解离度大,Proˉ解离度居中,甘 aaCOOˉ解离度小,迁移顺序为(pH6.8)Clˉ Proˉ —COOˉ。在 Clˉ与 Proˉ之间和 Proˉ与—COOˉ之间都将出现低离子区,同时也出现高电势,高电势迫使 Proˉ向 Clˉ迁移,—COOˉ向 Proˉ迁移。如:一个 Clˉ领路,—COOˉ推动,蛋白在中间,这样就起到浓缩的作用了。在浓缩胶运动中,由于胶联度小,孔径大,Proˉ受阻小,因此不同的蛋白质就浓缩到分离胶之上成层,起浓缩效应,使全部蛋白质处于同一起跑线上。当蛋白质进入分离胶时,此时Proˉ,Clˉ,甘 aa 离子在 pH8.8 的溶液中,Clˉ完全电离而很快到达正极,甘 aa 电离度加大很快跃过蛋白质,而到达正极,只有蛋白质分子在分离胶中较为缓慢的移动,并被筛分而依各自的大小分离。SDS的有效分离范围取决于用于灌胶的聚丙烯酰胺的浓度和交联度。甲叉双丙烯酰胺和丙烯酰胺在过硫酸胺的作用下聚合形成胶。过硫酸铵(AP)在隔氧的状态下,最好现配现用,使用新鲜的。TEMED即四甲基乙二胺,为加速催化剂。交联后,形成SDS-蛋白复合物必须通过的小孔。这些小孔的孔径随甲叉双丙烯酰胺和丙烯酰胺的比率增加而变小,比率接近1:20时孔径达到最小。而其比率大多按1:29配制,试验表明他能分离大小相差只有3%的蛋白质。SDS聚丙烯酰胺凝胶的分离范围:3.试剂和器材:10%SDS10%过硫酸铵(新鲜配制) 1.5M Tris-HCl1.0M Tris-HCl30%丙稀酰胺TEMED原液考马斯亮蓝R-250染色液(考马斯亮蓝R250+甲醇+冰醋酸) 脱色液(甲醇+冰醋酸)蛋白质样品上样缓冲液(5mol/L Tris-HCl pH6.8+甘油+10%SDS+β-巯基乙醇+0.1%溴酚蓝+加水定容)电极缓冲液(pH8.3,SDS+Tris+Gly,加水定容)垂直板电泳槽电泳仪长滴管及微量加样器烧杯、量筒、培养皿枪头、注射器等操作步骤:(1)清洗玻璃板一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉 ?轻轻擦洗。两面都擦洗过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在筐里晾干。晾干的玻璃板使用前需用干净的擦镜布擦干净(2)灌胶与上样将两块玻璃板对齐后,且较为平整的一端向下放入制胶架夹中卡紧。然后垂直卡在架子上,下端与橡胶垫紧密贴合。可以加入适量蒸馏水验漏,看液面是否下降,不下降则表明不漏。按照配方表配制分离胶(蒸馏水、30%丙烯酰胺、1.5M TrisHCl、10%SDS、10%过硫酸铵以及TEMED),加入 TEMED 后立即搅拌摇匀即可灌胶。灌胶时,待胶面升到绿带中间线高度时即可。然后胶上加一层水,液封后的胶凝的更快,且胶面平整。灌胶时开始可快

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