生物化学重中之重.ppt

吡喃型果糖（C2酮基C6羟基半缩醛反应）D、L 和α 、β型判断： DL型：由于其最远手性碳（C5*）未参与成环，根据Haworth书写原则：若5位羟基在下，根据左上右下，则对应与Fisher式的直链右侧，而右侧对应与D型甘油醛，所以5位羟基在环下为D型，反之，在环上为L型。 α 、β型：根据Fisher书写原则：半缩醛（酮）羟基（C2）与最远手性碳羟基（C5）在碳直链同侧为α型，异侧为β型。所以，看C5羟基与C2羟基（发生半缩酮反应的碳原子上的羟基）在Haworth式的朝向：同向α型,异向β型。 己醛糖形成多少旋光异构体? 开链式：手性碳4个，所以16个 每种异构体的环式： 吡喃型异头物，2个 呋喃型异头物: 2个 所以是4*16=64个 与P25矛盾吗？非也，书中的语言背景是链式结构。 己酮糖形成多少旋光异构体? 开链式：手性碳3个，所以8个 每种异构体的环式： 吡喃型异头物，2个 呋喃型异头物: 2个 所以是4*8=32个 变旋光现象：糖在溶液中可以由一种环状结构通过开链结构转变为另一种环状结构，随之比旋光度也产生变化的现象称为变旋光现象。 在溶液中，糖的链状结构和环状结构(?、?)之是可以相互转变，最后达到一个动态平衡，称为变旋现象。变旋现象是因为糖在溶液中发生了化学变化？非也，仅是糖分子结构发生α型、β型的转变 成苷反应 α-D-甘露糖比旋度为+29.3°，β-D-甘露糖比旋度为 -17.0°，在水溶液中产生变旋光现象，平衡混合物的比旋光度为+14.2°，计算平衡混合物中两种异头物所占的摩尔百分比。 解: 设α-D-异头物为X(mol百分数) β-D-异头物为Y(mol百分数) 则29.3X+ (-17.0)×( 1-X)=+14.2 X =0.674 Y =0.326 (b) 带电性质 ：不同磷脂的极性头部所带电荷的种类是不同的,因此,这些磷脂在不同的pH条件下解离所带电荷的种类和数量也是不同的,因而可以通过电泳把它们彼此分开. 以磷脂酰为例，pH7时，磷酸基带-1电荷、几种常见的甘油醇磷脂的净电荷如下: 苏氨酸(Thr)有四种异构体 氨基酸等电点的计算 对谷氨酸：A+ Ao A- A2- 例：Lys ε-+NH3 pK=10.5求ε- +NH3 在pH9.5时的质子化%。 解: ε- +NH3 = ε-NH2 + H + 根据公式：pH=pK+lg([质子受体]/[质子供体]) 9.5=10.5 +lg([ε-NH2 ]/[ε- + NH3 ]) lg([ε- NH2 ]/[ε-+NH3 ])=-1 [ε-NH2 ]/[ε-+NH3 ]=1/10 质子化%=10/(10+1)=91% 例：Lys ε-+NH3 pK=10.5求ε- +NH3 在pH=12.5时的质子化%。 解: ε- +NH3 = ε-NH2 + H + 根据公式：pH=pK+lg([质子受体]/[质子供体]) 12.5=10.5 +lg([ε-NH2 ]/[ε- + NH3 ]) lg([ε- NH2 ]/[ε-+NH3 ])=2 [ε-NH2 ]/[ε-+NH3 ]=1/100 质子化%=100/(100+1)=99% 肽键的部分双键特性足以防止肽健C-N的旋转，但蛋白质中的每一个N-C?键和每一个C?-C键都可以自由旋转；肽平面内的两个C?是否可以处于顺式构型或反式构型？ 酶与底物的结合 “锁钥学说”（Fischer，1890）：酶的活性中心结构与底物的结构互相吻合。整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的，酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样，并假设酶与底物的结合处至少有三个点，而且只有一种情况是完全结合的形式。 对于一个病毒DNA分析，发现碱基摩尔分数是A＝0.32、G＝0.16、T＝0.4、C＝0.12，由此判断DNA是单链DNA，因不符合配对原则。 1μmDNA双螺旋核苷酸的平均对数为2941 螺距为3.4 nm，1*1000/3.4＝294.1圈 10bp/圈，所以有2941对核苷酸 在RNA序列AACCGACGUACACGACUGAA和 AACCGUCGAGCACUGCUCGC中形成局部双链的是？p191 纸电泳分离AMP、ADP、ATP 缓冲液pH=4.8 第一磷酸基pK0.8-0.9，碱式存在，解离 腺嘌玲环1位质子化解离，不带电 第二磷酸基pK6.0左右，酸式存在，不解离 磷酸二酯键化得磷酸根中的磷酸基只有一个解离常数，p