南海北部巴士海峡深海沉积物中几丁质酶基因多样性分析-广东农业科学.PDFVIP

140 广东农业科学… 2015年第13期 南海北部巴士海峡深海沉积物中 几丁质酶基因多样性分析 戴世鲲，王广华，李  涛，吴华莲，向文洲 （中国科学院南海海洋研究所/中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室，广东…广州………510301） 摘  要：海洋微生物是新颖几丁质酶基因的重要来源。构建南海北部巴士海峡深海表层沉积物几丁质酶基因 文库，得到几丁质酶氨基酸序列共计114条。以0.3的距离划分OTU，得到54个OTU单元，丰富度指数Chao1值 为159.86，多样性指数Shannon和Simpson值分别为3.39和0.06。对54条OTU单元的代表序列，利用BLAST…程 序与GenBank…基因库中的序列比对，所有序列均发现具有几丁质酶基因的保守位点，相似性最高为97%，最低为 41%，31个OTU单元的代表序列来自于未培养微生物。结果表明，在南海北部深海沉积环境中具有丰富的几丁质 酶基因多样性，蕴藏着大量未知的几丁质酶基因资源。 关键词：南海；深海沉积物；几丁质酶 + 中图分类号：Q346.5… … … … … 文献标识码：A… … … … … 文章编号：1004-874X（2015）13-0140-06 Phylogenetic diversity analysis of chitinase gene in  deep-sea sediments from the Bashi Channel  in the northern South China Sea DAI…Shi-kun，WANG…Guang-hua，LI…Tao，WU…Hua-lian，XIANG…Wen-zhou （South China Sea Institute of Oceanology ，Chinese Academy of Sciences/ Key Laboratory of Trop ical Marine Bio-resources and Ecology ，Guangzhou 510301，China ） Abstract ：Marine…microbe…is…an…important…source…of…novel…chitinase…gene.…The…chitinase…gene…library…of…the…deep-sea… surface…sediments…of…the…Bashi…Channel…in…the…northern…South…China…Sea…was…constructed，and…114amino…acid…sequences… of…chitinase…were…obtained，which…were…divided…into…54operational…taxonomic…units（OTUs）based…on…0.3distance.…The… Chao1of…richness…index…was…159.86，and…the…Shannon…and…Simpson…of…diversity…index…were…3.39and…0.06，respectively.…By… BLAST…analysis…in…GenBank，the…conservative…sites…of…chitinase…gene…were…found…in…all…54OTU…representative…sequences.… The…highest…similarity…was…97%，and…the…lowest…similarity…was…41%.…31OTU…representative…sequences…came…from… uncultured…microbes．The…results…indicate…that…the…ch