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7方法在丙氨酸多肽链中的应用
浙江理工大学学报自然科学版第 卷第 期 年 月
方法在丙氨酸多肽链中的应用
贾红霞靳聪明
浙江理工大学理学院杭州
摘 要蛋白质的构象变化在生命过程中起着重要的作用蛋白质在发挥其功能时常伴有构象变化有些疾病
也是由蛋白质的构象发生变化引起的典型的例子如老年痴呆疯牛病等就是某些蛋白质的构象由水溶性的蛋白变
成了不溶性的纤维性蛋白引起的知道构象变化的过程对理解蛋白质相关性质起着重要作用但从原子尺度研究
构象变化是极具挑战的问题 文章利用 方法从原子尺度研究了多肽链的 螺旋和 螺旋之间的构象变化
文中用零温度 方法研究多肽链 螺旋和 螺旋之间的构象变化 从不同的初始路径得到了不同的最优路径
和过渡态其中有显著势垒的过渡态是与 螺旋相似的构型利用有限温度 方法研究多肽的构象变化采用
了 动力学和分子动力学两种采样法 得到了它的转移路径系综 通过与零温度 方法结果比较说明了
模拟结果的有效性
关键词 方法多肽链转移路径构象变化
中图分类号 文献标志码 文章编号 引用页码
蛋白质构象变化就是蛋白质从一个状态变化到
引 言
另一个状态 蛋白质在行使其生理功能时往往会发
蛋白质构象变化决定了蛋白质的性质蛋白质 生构象变化蛋白质构象变化发生的时间尺度大多
在发挥其功能时常伴有构象变化研究蛋白质构象
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