小球藻联产油脂和虾青素的基元模式分析-生物加工过程.pdfVIP

第 １２卷第４期 生　 物　 加　 工　 过　 程 Ｖｏｌ１２ Ｎｏ４ ２０１４年７月 ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｐｒｏｃｅｓｓ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｊｕｌ２０１４ － ｄｏｉ：１０３９６９／ ｊｉｓｓｎ１６７２ ３６７８２０１４０４０１５ 小球藻联产油脂和虾青素的基元模式分析 赵权宇，于水燕，张保国，史吉平 （中国科学院 上海高等研究院，上海 ２０１２１０） 摘　 要：构建了包含虾青素合成途径的小球藻代谢网络模型，集成文献报道同位素标定的小球藻代谢通量数据，估 算了胞内代谢通量分布。 在正常和缺氮培养条件下，虾青素的代谢通量分别为０３８和０３５。 计算得到基元模式 共６４０条，通过最大熵原理算法求取了正常培养和缺氮培养条件下的基元模式概率。 存在４条关键基元模式，在２ 种培养条件下，其基元模式概率之和分别为６０９５％和７７５３％。 虾青素的最大理论合成产率为１１２７％，但是这４ 条关键基元模式并不包括虾青素的合成反应。 关键词：虾青素；小球藻；基元模式；代谢途径 － － － 中图分类号：Ｑ５９１　 　 　 　 文献标志码：Ａ　 　 　 　 文章编号：１６７２ ３６７８（２０１４）０４ ００７６ ０６ Ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ ｍｏｄｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ ｓｐ ｆｏｒ ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ ｌｉｐｉｄ ａｎｄ ａｓｔａｘａｎｔｈｉｎ ＺＨＡＯ Ｑｕａｎｙｕ，ＹＵ Ｓｈｕｉｙａｎ，ＺＨＡＮＧ Ｂａｏｇｕｏ，ＳＨＩＪｉｐｉｎｇ （Ｓｈａｎｇｈａｉ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｃｈｉｎｅｓｅ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｓｈａｎｇｈａｉ ２０１２１０，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｃｏｍｂｉｎｅｄ ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ ｌｉｐｉｄ ａｎｄ ｈｉｇｈ ｖａｌｕｅ ａｄｄｅｄ ｐｒｏｄｕｃｔｓ ｗｅｒｅ ｐｏｓｓｉｂｌｅ ｔｏ ｄｅｃｒｅａｓｅ ｔｈｅ ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｃｏｓｔ ａｎｄ ｉｍｐｒｏｖｅ ｔｈｅ ｅｃｏｎｏｍｉｃ ｂｅｎｅｆｉｔ． Ｔｈｅ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ ｏｆ ａｓｔａｘａｎｔｈｉｎ ｉｎ Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ ｓｐ． ｗａｓ ｌｏｗｅｒ ｔｈａｎｔｈａｔ ｉｎＨａｅｍａｔｏｃｏｃｃｕｓｐｌｕｖｉａｌｉｓ．Ｔｈｅａｓｔａｘａｎｔｈｉｎｗａｓｐｏｓｓｉｂｌｅｆｏｒ ｃｏｍｍｅｒｃｉａｌ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｆｔｅｒ ｔｈｅ ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ ｏｆ ｌｉｐｉｄｓ ｉｎ ｌａｒｇｅ ｓｃａｌｅ ｃｕｌｔｉｖａｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ ｓｐ． Ａ ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｎｅｔｗｏｒｋ ｏｆ Ｃｈｌｏｒｅｌｌａ ｓｐ． ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ａｓｔａｘａｎｔｈｉｎ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｐａｔｈｗａｙ ｗａｓ ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄ． Ｔｈｅ ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ ｆｌｕｘ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｗａｓ １３ ｅｓｔｉｍａｔｅｄ ｂｙ ｉｎｔｅｇｒａｔｉｎｇ Ｃｔｒａｃｅｒ ｍｅｔａｂｏｌｉｃｆｌｕｘｅｓ．Ｔｈｅｍｅｔａｂｏｌｉｃｆｌｕｘｅｓｏｆ ａｓｔａｘａｎｔｈｉｎｕｎｄｅｒ ｎｏｒｍａｌ ａｎｄ ｎｉｔｒｏｇｅｎ ｌｉｍｉｔｅｄ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ ｗｅｒｅ ０３８ ａｎｄ ０３５， ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ． Ａ ｔｏｔａｌ ｏｆ ６４０ ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ ｍｏｄｅｓ ｗａｓ ｏｂｔａｉｎｅｄ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｔｈｉｓ ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｎｅｔｗｏｒｋ ｍｏｄｅｌ． Ｔｈｅ ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｉｅｓ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｅｌｅｍｅｎｔａｒ