应用illuminamiseq高通量测序技术分析河西走廊地区盐-微生物学报.pdfVIP

微生物学通报 Sep. 20, 2017, 44(9): 2067−2078 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160824 研究报告 应用 Illumina MiSeq 高通量测序技术分析河西走廊地区 盐碱土壤微生物多样性 1* 1 2 1 1 1 1 1 牛世全 龙洋 李海云 达文燕 胡山 李渭娟 朱学泰 孔维宝 (1. 730070) (2. 730070) 摘 要：【目的】以甘肃省河西走廊地区的9 个盐碱土壤样品(原生盐碱土、次生盐碱土、农田 土)为材料，研究该地区盐碱土壤中微生物群落的多样性。【方法】提取土壤微生物总DNA ，应 用Illumina MiSeq 高通量测序技术进行分析。【结果】从分布在河西走廊3 个流域的9 个盐碱 土样品中共获得325 089 条微生物的 16S rRNA 基因序列。冗余分析和热图分析表明，原生盐 碱土与次生盐碱土、原生盐碱土与农田土微生物群落构成差异较大，次生盐碱土与农田土微生 物群落差异较小。土壤pH 对微生物群落组成的影响最显著。多样性指数和稀释性曲线分析得 出，在9 个土壤样品中，S6 号Shannon 指数最大，S1 号Shannon 指数最小，S1 号Simpson 指 数最大，S6 号 Simpson 指数最小，说明原生盐碱土的微生物群落多样性最低，次生盐碱土的 微生物群落多样性最高。盐碱土壤中主要的微生物群落包括9 个门，其中变形菌门占主导地位， 其余依次是放线菌门、拟杆菌门、酸杆菌门、浮霉菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门和 疣微菌门。原生盐碱土和农田土中占优势的微生物群落是变形菌门，次生盐碱土中占优势的微 生物群落是放线菌门。【结论】河西走廊地区盐碱土壤中微生物多样性非常丰富，存在大量的 微生物类群，尤其是在次生盐碱土壤中。 关键词：Illumina MiSeq 高通量测序，盐碱土，河西走廊 Foundation item: National Natural Science Foundation of China (No. *Corresponding author: E-mail: sqniu@ Received: November 14, 2016; Accepted: June 06, 2017; Published online () : June 26, 2017 基金项目：(No. *通讯作者：E-mail sqniu@ 收稿日期：2016-11-14 ；接受日期：2017-06-06 ；优先数字出版日期() ：2017-06-26 2068 微生物学通报 Microbiol. China 2017, Vol.44, No.9 Microbial diversity in saline alkali soil from Hexi Corridor analyzed by Illumina MiSeq high-throughput sequencing system NIU Shi-Quan 1* LONG Yang 1 LI Hai-Yun2 DA Wen-Yan 1 HU Shan1 LI Wei-Juan 1 ZHU Xue-Tai1 KONG Wei-Bao1 (1. College of Life Science, Northwest Normal University, Lanzhou, Gansu 7300