传染性法氏囊病病毒BC6/85株全基因组克隆及其序列分析.pdfVIP

传染性法氏囊病病毒BC6/85株全基因组克隆及其序列分析.pdf

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2013,47(12):17—21/于 雷 ,等 中国兽药杂志 传染性法氏囊病病毒 BC6/85株全基因组克隆 及其序列分析 于 雷,王秀丽,杨承槐,李俊平,李启红,刘 丹,黄建华,李慧姣 (中国兽医药品监察所,北京 100081) [收稿 日期]2013—06—28 [文献标识码]A [文章编号]1002—1280 (2013)12—0017—05 [中图分类号]$852.65 [摘 要] 以传染性法氏囊病病毒(IBDV)BC6/85株基因组 RNA为模板,采用RT—PCR方法扩 增并克隆了IBDVBC6/85株基因组全长cDNA。序列测定结果表明:A节段全长共3260个核苷酸, 与IM株的同源性最高为97.4%,与其他血清 I型毒株的核苷酸同源性介于91.2% ~97.1%;B节 段有2827个核苷酸,与IM株同源性最高为98.6%,与其他毒株的核苷酸同源性为88.7%~98.6%。通 过对编码的氨基酸序列进行分析,发现BC6/85株有21个特有氨基酸,其 中15个位于多聚蛋 白 VP2—4—3。系统进化树分析表 明,BC6/85株与经典毒株、弱毒株和变异株的关系较近 ,而与超强 毒株相对较远。 [关键词] 传染性法氏囊病病毒;全基因组;序列分析 SequenceAnalysisoftheCompleteGenomeofIBDV BC6/85 YULei,WANGXiu-li,YAN GCheng—huai,HJun-ping,LIQi-hong,LIUDan,HUANGJina-hua,LIHui—jia0 (ChinaInstituteofVeterinaryDrugControl,Beijing100081,China) Abstract:Thefull—lengthofdoublesegmentsoftheinfectiousbursaldiseasevirus(strainBC6/85)was amplifiedbyRT—PCR and sequenced.TheresultsshowedthatsegmentA contained3260bp.comparedwith otherIBDV strains,BC6/85 segmentA shared91.2% ~97.4% homology atnucleotide level,segmentB contained2827bp.which shared88.7% ~98.6% homoloyg.Theanalysisofdeducedamino acid sequences indicatedthatIBDV BC6/85 strain had21specificresidues.PhylogenetictreeanalysisindicatedBC6/85was morecloselyrelatedtotheattenuated,classicalandvariantIBDV thanthoseofveryviurlentIBDV strains. Keywords:infectiousbursaldiseasevirus;completegenome;sequenceanalysis 传染性法 氏囊病 (InfectiousBursalDisease, 以来,我国和其他国家及地区又不断分离到 IBDV IBD)是由传染性法 氏囊病病毒 (Infectiousbursal 变异株和超强毒 (vvlBDV)株。变异株和 vvlBDV diseaseviurs,IBDV)引起的一种危害青年鸡 的烈 能突破 由经典毒株致弱的活疫苗或灭活疫苗提供 性、高度接触性传染病,主要侵害淋巴组织 (法 氏 的保护作用,导致雏鸡发病,从而使该病的控制更 囊)¨。本病 自被发现 以来,一直是危害养禽业 的 加 困难 。IBDV属于双 RNA病毒科 ,其基因组 由 重要疫病之一。我国自1979年周蛟 等在北京郊 A、B两节段组成,A节段包括 2个部分重叠的开放 区鸡场发现该病并于 1982年分离出病毒以来,全 阅读框 (ORF1和 ORF2),其中ORF2编码 VP5蛋

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