分子遗传10.ppt

分子遗传学的内容 第一章 遗传的物质基础-DNA 第二章 有机体、染色体和基因 第三章 DNA的复制 第四章 转录 第五章 翻译(蛋白质的生物合成) 第六章 原核生物基因表达调控 第七章 真核生物基因表达调控 第八章 遗传重组与基因工程 第九章 突变 第十章 遗传与进化 a 1 第十章 遗传与进化 分子水平的进化 一、进化研究的传统方法 二、利用生物分子研究 生物进化 一、进化研究的传统方法 ●古生物学 ●分类学 ●胚胎发生学 ●比较解剖学 ●生物地理学 ●生理学 ●普通遗传学 ●语言学 第一节 生物进化的理论 一、拉马克学说 二、达尔文Darwin和他的进化论 思考： 行万里路 生命演化的历史书 始 祖 鸟 比较解剖学：同源器官 胚胎学证据：脊椎动物的胚胎发育 细胞色素C的分子进化 隔离 基因漂流（gene flow） 遗传漂变(Genetic Drift)----基因频率的改变 Ladies,take your pick 传粉动物与植物 蝴蝶与斑点丝瓜 蛇与蜥蜴 毛里求斯岛上，渡渡鸟1781年灭绝，300多年来，岛上的卡尔瓦利亚树再无新的萌生苗。 适应辐射(adaptive radiation) 二、利用生物分子研究生物进化 自1859年 Darwin 的物种起源 (Origin of Species) 发表以来，进化论成为对人类自然科学和自然哲学发展的最重大贡献之一。进化论研究的核心是描述生物进化的历史(系统进化树)和探索进化过程的机制。自本世纪中叶以来，随着分子生物学的不断发展，进化论的研究也进入了分子水平。当前分子进化的研究已是进化论研究的重要手段，并建立了一套依赖于核酸、蛋白质序列信息的理论方法。 ???? 序列相似性比较。就是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与此序列相似的已知序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包有BLAST、Clustal、Phylip、Multalin、GeneDoc、FASTA等； l??????? 序列同源性分析。是将待研究序列加入到一组与之同源，但来自不同物种的序列中进行多序列同时比较，以确定该序列与其它序列间的同源性大小。这是理论分析方法中最关键的一步。完成这一工作必须使用多序列比较算法。 进化分析相关软件的因特网地址 ******************************************************** 序列分析和多序列比较 # BLAST Web site /BLAST/ # FASTA at EBI http://www2.ebi.ac.uk/fasta3/ # CLUSTALW software ftp://ftp-igbmc.u-strasbg.fr/pub/ClustalW # HMMER software / # SAM profile software /research/compbio/sam.html # BCM Search Launcher :8088/searchlauncher/launcher.html 系统进化树构建和稳定性分析 # PHYLIP /phylip.html # Hennig86 /~mes/hennig/software.html # MEGA/METREE /faculty/nei/imeg # GAMBIT /mcdbio/Faculty/Lake/Research/Programs/ # MacClade /macclade/macclade.html # PAUP /PAUP/ # GCG software package