沙鳅亚科鱼类线粒体DNA控制区结构分析及系统发育-水生生物学报.PDF

第 29 卷 第 6 期 水 生 生 物 学 报 Vol . 2 9 ,No . 6 2 0 0 5 年 1 1 月 ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA Nov. , 2 0 0 　5 沙鳅亚科鱼类线粒体 D NA 控制区结构分析及系统发育关系的研究 1 ,2 1 2 2 唐琼英 　刘焕章 　杨秀平 　熊邦喜 ( 1 中国科学院水生生物研究所 ,武汉 　430072 ; 2 华中农业大学水产学院 ,武汉 　430070) 摘要 :对沙鳅亚科鱼类 3 属 14 个代表种的线粒体 DNA 控制区序列的结构进行了分析 。通过与鲤形 目鱼类的控制 区序列进行比较 ,将沙鳅亚科鱼类的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域 。同时识别了沙 鳅亚科中一系列保守序列 ,并给出了它们的一般形式 。以胭脂鱼为外类群 ,对比条鳅亚科 、花鳅亚科 、以及平鳍鳅 科的代表性种类 ,采用 NJ 、MP 和 ML 法构建沙鳅亚科的分子系统树 。分子系统发育分析表明 ,沙鳅亚科为一单系 , 包括 3 个属 :沙鳅属 、副沙鳅属和薄鳅属 ,各属均构成单系 。根据分子系统学 、形态学的结果及地理分布推断 ,沙鳅 亚科中沙鳅属可能为最为原始的属 ,副沙鳅属其次 ,而薄鳅属最特化 。 关键词 : 沙鳅亚科 ;线粒体 DNA ;控制区;系统发育 ( ) 中图分类号 :Q951 　　文献标识码 :A 　　文章编号 2005 　　鱼类线粒体 DNA 作为一种分子标记 目前已被 关沙鳅亚科控制区序列的分析还未有报道 ,本研究 广泛应用于系统学研究[ 1 —3 ] 。线粒体 DNA 中的控 拟通过对沙鳅亚科 3 属 14 个代表种控制区序列的 制区即Dloop 区为非编码区 ,不编码蛋白质 ,受到选 研究 ,分析沙鳅亚科的系统发育关系 ,从而为整个鳅 择压力较小 ,因此积累了较多的突变 ,如碱基替换 、 科分类及系统发育关系的研究提供分子基础 。 插入 、缺失 , 以及众多的串联重复序列等 。控制区较 1 　材料和方法 ( 为复杂 ,分为 3 个区段 ,终止序列区 Extended termi ) ( nation associated sequence , ETAS 、中央保守区 Cen 11 　材料 　研究中选择了沙鳅亚科 3 属共 14 个代 ) ( tral conserved dormain , CD 和保守序列区 Conserved 表种 ,进行控制区序列的结构分析 。同时 ,选取了鳅 ) ( ) ( ) sequence block , CSB ,不同区段进化速度不同 ,故可 科中条鳅亚科 Nemacheilinae 和花鳅亚科 Cobitinae