水稻响应高温胁迫的miRNAs差异表达分析Analysis of differential expression of miRNAs in response to high temperature stress in Rice.pdfVIP

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2017-12-06 发布于山东
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水稻响应高温胁迫的miRNAs差异表达分析Analysis of differential expression of miRNAs in response to high temperature stress in Rice.pdf

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水稻响应高温胁迫的miRNAs差异表达分析Analysis of differential expression of miRNAs in response to high temperature stress in Rice

万方数据万方数据万方数据中文摘要随着全球气候变暖的趋势越来越严重，高温对作物的危害已日益受到人们的重视。水稻作为一种原产热带和亚热带的喜温作物,其各个生育阶段都有一定的适宜温度范围,当气温超过这个范围时,就不利于其生长发育,会对水稻的生长发育和产量、品质形成过程造成较严重的危害。 miRNA 属于动物和植物中存在的一类最小的功能ncRNA，通过与靶mRNA 上特异的互补位点结合而在转录后水平抑制基因的表达。有些miRNA 显示出在组织细胞的不同发育期或不同组织类型的严格特异性模式表达，而另一些miRNA 在生物体中广泛表达。相关研究表明，miRNA 参与植物拟南芥花器官发育和开花调控的过程，而温度对于水稻抽穗时期的影响也是至关重要的。因此对水稻高温胁迫相关研究也就变得迫切需要。应用二代测序的方法，比较水稻抽穗开花时期的组织中 miRNAs 的表达差异情况，找出有差异表达的miRNA ，通过qRT-PCR 验证某个具有显著差异的miRNA 的表达情况。具体步骤如下：（1）对照组以及经高温胁迫的处理组混和样品两个实验样品作为实验材料，应用Ion Proton 平台(ABI)分析miRNA 的表达差异，过程包括从组织样RNA 提取、文库构建、滴定和测序平台上进行测序、并使用相关的数据分析软件，得到有23 个差异表达的miRNA 。（2 ）对照组和高温胁迫处理组的样品分别提取总RNA，并逆转录成cDNA 进行后续的实验。根据 miRNA 数据库和相关文献，设计引物，采用 qRT-PCR 方法验证 Osa-miR159c 、Osa-miR159d 、Osa-miR159f 、Osa-miR156c-3p 、Osa-miR167c-3p 、 Osa-miR164d 、Osa-miR529b 、Osa-miR528-5p 、Osa-miR166b-3p 、Osa-miR166h-3p 在高温胁迫下水稻开花时期的表达差异情况。关键词水稻穗，miRNA，高温胁迫，qRT-PCR Ion Proton 平台 I 万方数据 Abstract With the more and more serious global warming trend, the harm of high temperature on crop has increasingly received peoples attention. Rice as a kind of native to tropical and subtropical thermophilic crops, its every stage has certain appropriate temperature range. The temperature which exceeds the range is not conducive to the growth and development and will cause serious harm on rice growth, yield and quality formation. MicroRNA belongs to the smallest functions ncRNA of animals and plants, which can combin with specific complementary loci on target mRNA and inhibit the expression of genes in the tr