基于microRNA深度测序的猕猴桃性别分化初探.pdf

园艺学报，2015 ，42 (7) ：1260 –1272. Acta Horticulturae Sinica 1260 doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0166；http ：//www. ahs. ac. cn 基于microRNA 深度测序的猕猴桃性别分化初探 1,2 3 1 1 1,* 闫明科 ，徐 强 ，刘春燕 ，张 琼 ，姚小洪 1 2 （ 中国科学院武汉植物园，中国科学院种质创新与特色农业重点实验室，武汉 430074 ； 中国科学院大学，北京 3 100049； 上饶职业技术学院，江西上饶 334109 ） 摘 要：利用新一代高通量测序技术，对猕猴桃雌花和雄花中表达的小 RNA 进行了测序，分别得到 雌花 18 408 610 条序列和雄花 11 191 469 条序列。通过生物信息学分析，共鉴定和预测得到 39 个保守 miRNA 家族和 400 个新的 miRNA 家族，其中有 170 个 miRNA 家族在雌、雄花样品间显著差异表达。对 差异表达 miRNA 进行靶基因的预测及注释，结果显示，靶基因产物具有包含核苷三磷酸水解酶的磷酸环 结构域的 miRNA 数量最多。在猕猴桃 25 号连锁群（Chr25 ）上共预测得到 3 个 miRNA ，其中 novel-ach-miR362 的靶基因Achn298021 可能与猕猴桃花的性别发育有关。 关键词：猕猴桃；microRNA ；深度测序；性别分化 中图分类号：S 663.4 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2015 ）07-1260-13 Preliminary Investigation on Sex Differentiation of Actinidia chinensis by High-throughput microRNAs Sequencing 1,2 3 1 1 1,* YAN Ming-ke ，XU Qiang ，LIU Chun-yan ，ZHANG Qiong ，and YAO Xiao-hong 1 （Key Laboratory of Plant Germplasm Enhancement and Specialty Agriculture ，Wuhan Botanical Garden，Chinese 2 Academy of Sciences ，Wuhan 430074 ，China； University of Chinese Academy of Sciences，Beijing 100049，China； 3Shangrao Vocational Technical College ，Shangrao ，Jiangxi 334109 ，China） Abstract ：The miRNAs in female and male flowers of kiwifruit were sequenced by next-gener