基于matK+基因和ITS+序列探讨大叶藻科的系统发育关系.docxVIP

水 生 生 物 学 报ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA第 35 卷 第 6 期2011 年 11 月Vo l . 35, No.6 Nov.,2 0 1 1DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00900基于 matK 基因和 ITS 序列探讨大叶藻科的系统发育关系渊 1李文涛 1孙典荣 2高天翔 1李(1. 中国海洋大学水产学院, 青岛 266003; 2. 中国水产科学研究院南海水产研究所, 广州 510300)摘要: 比较分析了 15 种大叶藻的 matK 基因和 ITS 片段的核苷酸序列, 结果发现胞嘧啶(C)在两个目的片段上含量均较低。ITS 基因片段检测到 228 处核苷酸替换, 表现出丰富的遗传多态性; matK 基因片段上有 249 处核苷酸替换, 且大部分替换来自于第三密码子的同义替换, 种间在氨基酸水平上产生了一定的分化。基于 matK 基因和 ITS 片段, 利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树结果基本一致,明显分为 4 大支, 大叶藻亚属、异叶藻属、拟大叶藻亚属和虾形藻属分别构成一支。大叶藻亚属和拟大叶藻 亚属的核苷酸差异值在 29.09%—35.51%, 超过了屈良鹄等提出的大部分被子植物 ITS 属间核苷酸差异值 (9.60%—28.80%), 在分子数据上两亚属都达到了属的水平。研究结果支持 Tomlinson 和 Posluszny 对大叶藻 科的划分结果, 建议将大叶藻科分为 4 个属。关键词: ITS; matK; 大叶藻科; 系统发育关系中图分类号: Q949; Q75文献标识码: A文章编号: 1000-3207(2011)06-0900-08亚属包含 7 个种, 其中 Zostera capensis Setchell、Zostera capricorni Ascherson、Zostera muelleri Ir- misch ex Ascherson、Zostera mucronata den Hartog和 Zostera novaelandica Setchell 仅分布于澳大利亚和 新西兰沿海, 矮大叶藻(Zostera japonica Ascherson andGraebner) 分 布于西北太 平洋沿岸 , 诺氏大叶藻 (Zostera noltii Hornemann) 分布于北大西洋和地中 海 [11] 。异叶 藻属仅 Heterozostera tasmanica denHartog 一个种, 分布于澳大利亚沿海和北美智利沿海[4]。虾形藻属共 5 个种, 分布于北太平洋沿岸[4]。 近年来的研究表明, 大叶藻科中虾形藻属的分类地位已经明确[2], 但大叶藻属与异叶藻属的划分仍存在分歧[2, 4, 8, 11—13]。随着分子生物学技术的应用[14, 15],大叶藻科的系统发育研究有了长足地发展[8, 11]。 大叶藻科物种都属于海草(Seagrasses), 海草是多种水生被子植物的总称, 是一个生态组群而不是 一个分类组群。Kuo 和 den Hartog[3]认为全球海草共有 4 科 12 属 60 种。海草场是一类具有极高生产力大叶藻科 (Zosteraceae) 隶 属于沼生 目 (Helo-biae)[1], 有 大叶藻 属 (Zostera)(12 种 ) 、 异 叶藻属 (Heterozostera)(1 种 ) 和 虾形藻属 (Phyllospadix)(5 种)3 个属[2, 3]。目前对于这 3 个属的归属尚有争议, 有学者认为它们属于大叶藻科(Zosteraceae)[4], 也有学者将其归于眼子菜科 (Potamogetonaceae) 的大叶 藻亚科[5]。大叶藻属包括大叶藻亚属(subgenus Zostera)和 拟大叶藻亚属(subgenus Zosterella)[3], 共 12 个种。大叶藻亚属包含大叶藻(Zostera marina Linnaea)、具 茎大叶藻 (Zostera caulescens Miki) 、 丛生大叶藻 (Zostera caespitosa Miki)、宽叶大叶藻(Zostera asi-atica Miki)和 Zostera pacifica Watson 5 个种, 均分布 于北半球。其中, 大叶藻广泛分布于太平洋和大西洋沿海, 具茎大叶藻和丛生大叶藻只分布于西北太平洋海域 ( 中 国、日本 、 韩国和俄 罗 斯东南海 域 ),宽叶 大叶藻分布 在太平洋海 域和北美沿 海 [6—9],Z. pacifica 仅分布