生物化学---第四章　酶（上）.pptVIP

* * 加入基质后活性区关閉開始催化反应 Stryer (1995) Biochemistry (4e) p.220 为Tyr 248 为Arg 145 为Glu 270 为底物 * * （三）酶的高效催化策略（影响因素） 1.底物与酶的邻近效应及定向效应 邻近效应： 　指酶与底物形成中间复合物(ES)后，使催化基团与底物结合成同一个分子而使有效浓度得到极大的提高 定向效应： 　指酶的催化基团与底物的反应基团之间正确取位所产生的效应 * * 包括 反应基团之间、酶催化基团和底物反应基团之间 活性中心内邻近定向使反应变成分子内反应 * * * * 2.底物的形变及诱导契合（底物分子敏感键扭曲变形） * * 3.酸碱催化　 　狭义：H+　OH-　参与的催化 　广义：H+　OH-的供体或受体参与的催化 　机制 　在机体内，多数处于中性条件，所以狭义酸碱催化所以占比例很小，多数是弱酸弱碱参与的反应 * * 广义酸基团 广义碱基团（质子供体） （质子受体） 酶分子中可以作为广义酸、碱的基团 His 是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团。 * * * * * * 4.共价催化： 　又称亲核催化或亲电子催化 　催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡产物，使反应活化能降低，从而提高反应速度的过程，称为共价催化。亲核试剂或亲电子试剂能分别释放电子或汲取电子并作用于底物的缺电子中心或负电中心，迅速形成不稳定的共价中间复合物 常见的亲核基团有：Ser-OH　Cys-SH His-OH 　典型的亲电子中心有：磷酰基、酰基、糖基 * * * * 例如,通常蛋白酶、酯酶等在催化时先形成底物和酰基和酶分子的共价结合中间物，此不稳定中间物易于将酰基转移给水而完成水解作用。 * * 5.金属离子催化 （1）分类 （2）作用机理： 　A 金属离子可以和水分子的OH-结合，使水显示出更大的亲核催化性能。 B 电荷屏蔽作用:电荷屏蔽作用是酶中金属离子的一个重要功能。 多种激酶(如磷酸转移酶)的底物是Mg2+－ATP复合物。 * * * * 6.多元催化及协同作用 7.活性部位微环境的影响（低介电微环境） * * 五、酶催化反应机制举例 1.丝氨酸蛋白酶族 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * （一）酶与普通催化剂的共性： 1.只能催化热力学上允许进行的反应，对于可逆反 应，酶只能缩短反应达到平衡的时间，但不改变平 衡常数； 2.酶也是通过降低化学反应的活化能来加快反应速度； 3.酶在反应中用量很少，反应前后数量、性质不变。 * 以蛋白脢 carboxypeptidase A 的 X-ray 繞射圖為例，來檢視蛋白質的動作情形。分子中央有一個鋅，其右側隱約可以看到一個凹陷的洞口，周圍還有三個胺基酸的基團，一起等個獵物上門。 * 當基質 進入活性區的凹陷口袋後，整個分子把基質吞入，洞口的幾個胺基酸基團收緊，然後在分子內部進行水解反應。其中以右側的 Tyr 基團動作最大，其運動的距離幾乎達到 20 埃。 * 第一阶段 酰化 Ser195---OH 中的氧攻击肽键的羰基碳，形成四联体过渡态（Ser195—OH、底物的酰基、底物的氨基、His的咪唑），敏感肽键断裂，底物中的胺成分通过氢键与酶的His57咪唑基相连，底物的羧基部分酯化到Ser195的羟基上。 第二阶段 脱酰 电荷中继网从水中吸收一个质子，结果产生的OH-攻击连在Ser195上底物的羧基碳原子，形成四联体过渡态，然后His57供出一个质子给Ser195上的氧原子，结果底物中的酸成分从Ser195上释放。 ? * * * * （二）按酶的结构分类 　1.单体酶 　由一条肽链构成的酶称为单体酶 　2.寡聚酶： 　由多条肽链以非共价键结合而成的酶 　3.多酶体系： 　一些功能相关的酶组织在一起，形成一个酶系,也叫多酶复合体 　 * * （三）按化学组成 单纯酶及结合酶 单纯酶：完全由蛋白质（氨基酸）组成，无辅助因子。属简单蛋白质，如水解酶。 结合酶：属结合蛋白，除蛋白质外，还有非蛋白部分,即辅助因子 辅助因子：金属离子或有机小分子。 * * 全酶 = 酶蛋白 + 辅助因子 辅助因子 金属离子作为辅助因子。 金属离子 辅酶 辅基 酶蛋白和辅助因子单独存在均无催化活性，只有二者结合为全酶才有催化活性。 * * 某些小分子有机化合物与酶蛋白结合在一起并协同实施催化作用，这类分子被称为辅酶（或辅基）。 辅酶（或辅基）是一类具有特殊化学结构和功能的化合物。参与的酶促反应主要为氧化-还原反应或基团转移反应。 大多数辅酶（或辅基）的前体主要是水溶性 B 族维生素。许多