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可用于计算蛋白质多肽体系中氢键强度的势能函数.pdf

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密级: 内部 rL曩卜 可用于计算蛋白质多肽体系中氢键强度的 势能函数 for An function analyticpotential hydrogen bondsin and peptides proteins 指导教师: 王长生教授 专业名称: 物理化学 论文答辩日期: 授予学位日期: 答辩委员会主席: 论文评阅人: 可用于计算蛋白质多肽体系中氨键强度的势能函数 目 录 目录 中文摘要…………………………………………………………………I 英文摘要……………………..:………………………………………III 第一章绪论……………………………………………………………1 1.1研究背景…………………………………………………………1 1.1.1氢键发展的历史……………………………………………l 1.1.2氢键的分类…………………………………………………3 1.1.3氢键的本质…………………………………………………4 1.1.4氢键的特点和对物质性质的影响…………………………5 1.1.5氢键在生物领域的重要意义………………………………8 O 1.2研究现状………………………………………………………l 1.2.1氢键的研究方法……………………………………………10 1.2.2研究现状……………………………………………………13 第二章理论基础和计算方法………………………………………16 6 2.1量子化学…………………………………………………1 2.1.1分子轨道理论……………………………………………19 2.1.2电子相关问题……………………………………………23 一 一爹嚣 可用于计算蛋白质多肽体系中氢键强度的势能函数 2.1.3密度泛函理论………………………………………………30 2.1.4基组问题…………………………………………………32 2.2分子力学………………………………………………………36 2.2.1分子力学概述………………………………………………36 2.2.2分子力场作用项的一般式…………………………………36 2.2.3分子力场的参数化…………………………………………47 2.2.4常见的力场…………………………………………………49 2.2.5氢键作用势能函数………………………………………53 第三章氢键势能函数的确定及应用………………..:…………55 3.1本文研究内容的确定……………………………………………55 3.2对HF二聚体的氢键势能曲线的研究…………………………55 3.3建立氢键势能函数…………………………

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