毛竹细胞色素P450的基因组学分析.pdf

植物生理学报 PlantPhysiologyJournal2014，50(9)：1387～1400 doi：10，13592~．cnki．PPJ．2014．0205 1387 毛竹细胞色素P450的基因组学分析 林翩翩 ，白有煌。，周明兵 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江临安3l13o0；浙江大学生命科学学院生物信息学系，杭州 310000 摘要：细胞色素P450单加氧酶(P450s)是一类在450nlTl处有特征吸收峰的血红素硫蛋白基因超家族，在许多物质代谢中至关 重要，还与解毒代谢密切相关。在毛竹基因组中鉴定出41个P450家族，共197个成员，涉及10个基因簇(clan)。通过基因结 构与进化树的比较，进一步了解结构与进化之间的联系：通过与水稻和拟南芥一起构建的进化树，分析了毛竹P450基因家 族的差异性。二级结构分析表明，毛竹P450蛋白序列同样具备有P450蛋白特征性结构域。在毛竹中，共有104个P450基因 能够在不同生长发育时期有不同程度的表达 关键词：毛竹；细胞色素P450；基因结构：系统进化树：进化 GenomicsAnalysisofCytochromeP450M onooxygenaseGenesinPhyllostachys heterocycla LIN Pian．Pian，BAIYou-Huang，ZHOUMing—Bing， TheNurturingStationfor eStateKeyLaboratoryofSubtropicalSil-Ficulture,Zh~iangA＆FUniversity,Linan．Zhejiang 311300,China,2BioinformaticsDepartment,Collegeo／L~eSciences，Zh~iangUniversity,Hangzhou310000,China Abstract：CytochromeP450monooxygenaseistheheme—sulfurprotein’Sgenesuperfamily,withthecharacter- isticabsorptionpeakin450nnl，whichpalysallimportantroleinthemetabolism ofmanysubstratesandisin— volvedintothemetabolism ofdetoxification．The 197P450genesthatbelongedto41familiesand 10clans wereidentifiedin尸 vllostachysheterocyclagenome．Thecomparisonbetweengenestructureand仃eeshowed there1ationbetweenthem．The仃eeofP450inP heterocycla．OryzasativanadArabidopsisthalianaindicated thedifferencesofP heterocycla’SP450superfamily．ThesecondarystructureshowedthataUP heterocycla P450sequencesalsoCOntainedthetypicalconserveddomains．In heterocycla．therewere104P450genes withdifferentexpressionlevelsindifferentgrowthperiods． Keywords：Phyllostachysheterocycla；cytochromeP450monooxygenase；genestructure；phylogenefictree；evolution 细胞色素P450单加氧酶(cytochromeP450 序列的相似程度 以及在系统进化树中的进化关系， monooxygenases，P450s)在生物进化的过程中，广 且 以后者为主(Nelson2006)。名称 中的第1个数字 泛存在于各种形式的生命体 中，包括动物、植 为家族编号，第1个大写英文字母为亚家族编号。 物、真菌和细菌，其单一的祖先蛋 白己实现了多 氨基酸序列相似性大于40％的序列可被归入同一 元化(Omura1999)。植物P450参与许多植物体 内 家族，相似性大于55％的序列可被归入 同一亚家族 的初级和次级代谢反应，并发挥重要的催化作