NOD2和STAT4基因多态性与中国汉族人群克罗恩病的相关性.docVIP

精品论文 参考文献 NOD2和STAT4基因多态性与中国汉族人群克罗恩病的相关性 王才华1 庞智2 （1江苏省张家港市广和中西医结合医院消化内科 江苏张家港 215633）（2江苏省苏州市立医院消化内科 江苏苏州 215008 ） 【摘要】背景：克罗恩病（CD）是一种慢性非特异性的胃肠道炎症性疾病。迄今CD的发病机制尚未完全明确，但是大量来自于包括全基因组关联研究在内的有关遗传危险因子的资料明显地加深了我们对其的理解。最近的研究揭示NOD2和STAT4基因的遗传变异与CD发病呈正相关。目的 本研究分析NOD2和STAT4基因的多态性与中国汉族人群CD发病的相关性。方法 选取汉族克罗恩病患者66例与健康对照者66名作为研究对象，抽提基因组DNA，采用聚合酶链式反应和直接测序方法检测克罗恩病患者和健康对照者NOD2和STAT4的基因型，计算基因型与基因频率，采用chi;2检验进行组间比较。结果 NOD2基因rs2066842位点CC、CT和TT基因型频率CD组分别为90.91%、9.09%和0%，健康对照组分别为93.94%、6.06%和0%,CD组C和T等位基因频率分别为95.5%和4.5%，健康对照组分别为97.0%和3.0%；STAT4基因rs7574865多态位点TT、TG和GG基因型频率在病例组中分别为0.136,0.409和0.455，在对照组中分别为0.091,0.439和0.470，T和G等位基因的频率在病例组分别为0.341和0.659，在对照组分别为0.311和0.689。CD组与对照组间各位点的基因型和等位基因频率差异均无统计学意义（P＞0.05）。结论 虽然NOD2和STAT4基因的遗传变异与西方白种人CD的易感性相关，但是该基因多态性却罕与中国汉族人明显相关。 【关键词】 NOD2 STAT4 克罗恩病 单核苷酸多态性 汉族人群 引言 炎症性肠病(inflammatory bowel disease, IBD)是慢性非特异性胃肠道炎症性疾病,主要包括溃疡性结肠炎(ulcerativecolitis,UC)和克罗恩病(Crohnsdisease,CD)[1,2]。过去欧洲和北美人群中IBD发病率较高,亚洲人群发病率较低,然而近20年来IBD在亚洲人群中的发病呈现明显增高趋势。IBD的病因和发病机制尚未完全明确,目前认为IBD的发病是由环境、遗传、感染和免疫等多种因素相互作用所致。同卵双生子共患病率高,IBD的家族聚集现象和IBD发病的种族差异性提示遗传因素是IBD发病过程中的一个重要因素。全基因组关联研究与传统方法相结合用以探索基因变异与发病风险的关系已使人们对于IBD的发生发展的认识有了很大提高。自从2001年Hugot等[3]确定第1个CD易感基因CARD15/NOD2以来,已相继发现了多个与IBD发病相关的易感基因和易感单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphism,SNP）位点,有关基因型与临床表型的关系也有报道。可以明确的是IBD是一种复杂的多基因疾病,其易感性涉及多个基因位点,且有着显著的种族差异性.迄今为止还没有找到与我国乃至亚洲IBD人群明显相关的基因和SNP位点,因此有必要在亚洲人群中展开大规模的易感基因及易感突变位点的筛查。因此我们同时对NOD2和STAT4基因单核苷酸多态位点与中国汉族人群CD的相关性进行了分析。 1 材料和方法 1.1 材料 收集2007年1月-2010年1月在苏州市立医院北区消化科门诊就诊或住院的临床诊断资料完整、彼此无血缘关系的克罗恩病患者66例（诊断标准依据中华医学会消化病学分会炎症性肠病协作组制定的《中国炎症性肠病诊断治疗规范的共识意见》）[8]，其中男性患者32例，女性患者34例，平均年龄36.26plusmn;11.82岁；所有患者均除外合并其他自身免疫性疾病,近1个月未使用皮质激素治疗，近3个月未使用过免疫抑制剂，无近期明确感染病史，无严重心、肺和神经、精神疾病，并除外糖尿病及其他内分泌疾病，肝、肾功能损害者，服用避孕药的女性育龄患者以及创伤者等。健康对照组66名，均为门诊体检健康者，其中男性33例，女性33例，平均年龄35.42plusmn;13.14岁；两组间年龄和性别没有显著性差异（均P﹥0.05）。 1.2 方法 1.2.1基因组DNA提取 采集EDTA抗凝静脉血2mL，按DNA抽提试剂盒（SK1342，上海生工）操作步骤从白细胞提取基因组DNA，溶解于TE缓冲液，定量后-20℃保存。 1.2.2 引物序列设计及扩增长度如下，