气孔蛋白同源物在单双子叶植物中的生物信息学分析Bioinformatics.PDFVIP

基因组学与应用生物学，2013 年， 第32 卷，第6 期，第752-760页 Genomics and Applied Biology, 2013, Vol.32, No.6, 752-760 研究报告 Research Report 气孔蛋白同源物在单、双子叶植物中的生物信息学分析 1 * 1 李有志 樊宪伟 韦葳 廖权能 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 生命科学与技术学院, 广西大学, 南宁, 530004 1 同等贡献作者 * 通讯作者, xwfan001@163.com 摘 要 本文对NCBI 数据库中的4 种单子叶植物(玉米, 高粱, 水稻和二穗短柄草)和5 种双子叶植物(筷子 芥, 大豆, 蒺藜苜蓿, 毛果杨和蓖麻) 的气孔蛋白同源物，利用生物信息学分析工具在基因结构、碱基组成、氨 基酸理化性质、信号肽结构、磷酸化位点、二级结构及三维结构上进行了比较分析，并构建系统进化树。结果 表明，单、双子叶植物中的气孔蛋白同源物在基因结构上均由3 个外显子和2 个内含子构成；编码的蛋白均 属于不稳定的疏水性蛋白，且存在信号肽结构和C 端保守的6 个半胱氨酸残基；在保守的成熟肽区段含有 酪蛋白激酶 磷酸化位点(T)，不含 -螺旋结构，但三维结