流感病毒通过组蛋.ppt

Nuclear localization and expression of NS1 protein in infected cells. Generation of reagents to study the function of the NS1“histone mimic” Flag-NS1 recombinant virus supports infection and replication In infected cells, NS1 is enriched at promoters characterized by the presence of H3K4me3 and RNA Pol II (Fig. 2a). 3、NS1 histone mimic controls antiviral gene expression IFIT1 and IFI6 genes, infection with the wild-type influenza virus resulted indecreased PAF1 and RNA Pol II levels at the transcriptional end sites(TES) and to a lesser extent at the transcriptional start sites (TSS) ofthe genes, as compared with PAF1-binding mutant virus (△PAF) NS1 suppresses antiviral gene transcription in infected cells. Infection with either wild-type or △PAF virus has no effect on transcriptional dynamics of housekeeping genes and genes not affected by viral infection (Fig. 3b) （参考文献36） NS1 inhibits transcriptional elongationin vitro. NS1 does not affect transcription of non-chromatinized DNA template in vitro hPAF1 does not control interaction between influenza RNA polymerase and cellular RNA Pol II. The hPAF1 binding sequence in NS1 regulates influenza virulence 4、hPAF1C controls antiviral gene expression and infection 流感病毒通过组蛋白的模拟机制抑制抗病毒反应 2012.5.2 概 念 epigenome：表观基因组 PAF1：The RNA Polymerase-associated Factor 1 the epigenetic：表观遗传学 目前很热门的研究领域。是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表达了可遗传的变化的一门新兴遗传学分支学科。 表观遗传学的特点： 可遗传的，即这类改变通过有丝分裂或减数分裂，能在细胞或个体世代间遗传； 可逆性的基因表达调节，也有较少的学者描述为基因活性或功能的改变； 没有DNA序列的改变或不能用DNA序列变化来解释。 表观遗传学的研究内容： 基因选择性转录表达的调控 DNA甲基化 基因印记 组蛋白共价修饰 染色质重塑 基因转录后的调控 基因组中非编码RNA 微小RNA（miRNA） 反义RNA 内含子、核糖开关等 组蛋白修饰 组蛋白修饰种类： 乙酰化-- 一般与活化的染色质构型相关联，乙酰化修 饰大多发生在H3、H4的 Lys 残基上。 甲基化-- 发生在H3、H4的 Lys 和 Arg残基上，可以 与基因抑制有关，也可以与基因的激活相 关，这往往取决于被修饰的位置和程度。 磷酸化-- 发生与 Ser 残基，一般与基因活化相关。 泛素化-- 一般是C端Lys修饰，启动基因表达。 SUMO（一种类泛素蛋白）化-- 可稳定异染色质。 其他修饰（如ADP的核糖基化） 1、ChIP-Sequencing is a new frontier technology to analyze protein interactions with DNA. ChIP-Se