基于SNP 的系统性红斑狼疮全基因组关联研究进展.docVIP

精品论文 参考文献 基于SNP 的系统性红斑狼疮全基因组关联研究进展 王 燕1，唐 亮1* (湖南省长沙医学院基础医学系410219) 【摘 要】系统性红斑狼疮(SLE)是一种具临床和血清学多样性的典型的自身免疫性疾病。基于多个SNPs 分析的单倍型关联研究已成为复杂疾病基因定位的一种更为有效 的手段。全基因组关联分析方法为SLE 的发病机制提供了重要线索。本文综述了系统性红斑狼疮相关的全基因组关联研究(GWAS)进展。为系统性红斑狼疮发病机制研究提供 一定参考。 【关键词】SNP; GWAS; SLE; 易感基因 早期对SLE 易感基因的相关性研究主要集中于主要组织相容性抗原复合物 (MHC-II)、补体基因缺陷和Fc 受体基因多态性[1]。目前认为，选择相对隔离人群， 对疾病相关调节通路的候选基因或通过基因组定位所限定的候选基因进行基于SNP 的关联研究，是一种有效的对多基因疾病易感基因进行定位的方法[2]。至今已有100 多个基因被认为与SLE 发病相关。 随着高通量基因分型技术的发展，各种新技术不断出现，比如质谱技术和SNP 芯 片，使得基因分型的成本不断下降，同时HapMap 的完成，使得一种新的研究方法—— 全基因组关联分析(genome-wide association studies，简称GWAS)[3]成为现实。新的全 基因组关联分析方法从根本上改变了基因研究的“蓝图”，利用基因芯片来全面扫描个 体DNA 样本数十万个SNPs，如此之高的SNP 密度使致病DNA 变异的研究变得更加 容易。 近年，全基因组关联研究(GWAS)已证实了30 个以上的风险基因与SLE 相关。 Han Jian-Wen[4]等对中国汉族人群1，047 例SLE 患者和1205 名健康对照进行GWAS 研究，并在其他的两个人群(3150 名SLE 患者和7050 名对照)中对78 个非MHC 的 SNP(来自67 个位点)做了重复验证研究，证实了9 个新的易感位点(ETS1，IKZF1， RASGRP3，SLC15A4，TNIP1，7q11.23，10q11.22，11q23.3 和16p11.2; 1.77 times; 10?25 le; P combined le; 2.77 times; 10?8)，并且确定了以往报道的7 个位点(BLK，IRF5，STAT4， TNFAIP3，TNFSF4，6q21 and 22q11.21; 5.17 times; 10?42 le;P combined le; 5.18 times; 10?12)。 Vesela Gateva1[5]等从大量GWAS 研究结果中得出的与SLE 相关(p＜0.05)的2466 个区 域中选择SNP 对1，963 病例和 4，329 名健康人的独立样本进行基因分型，这一复 制研究证实了5 个新的SLE 易感位点(p＜5 times; 10?8)：TNIP1 (OR = 1.27)，PRDM1 (OR = 1.20)，JAZF1 (OR = 1.20)，UHRF1BP1 (OR = 1.17) and IL10 (OR = 1.19)。 目前，越来越多的研究开始关注于基因单核苷酸多态性对于免疫信号通路中涉及 的各个基因的影响及其与系统性红斑狼疮的关联性。随着基因组研究和基因芯片技术 的不断完善和发展，GWAS 在探究系统性红斑狼疮的发病机制中将起到重要作用。 参考文献 [1] Su K，Wu J，Edberg JC，etal.A promoter haplotype of the immuno receptor tyrosine based in hibitory motif bearing Fcgamma RII balters receptor expression and associates with autoimmunity.I.Regulatory FCGR-B polymorphism sand their association with systemic lupus erythematosus[J].Immunol 2004，172(11):7186-7191. [2] Hardy J，Singleton A，Genomewide association astudies and human disease. N Engl J Med，2009，360:1759-1768. [3] Samani NJ，Erdmann J，Hall AS，Hengstenberg