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园艺与种苗
DNA多态性的分子标记方法。 1.5 内部简单序列重复(inter—simple sequence re—
1.4 简单序列重复(simple sequence repeat.SSR) peat,ISSR)
简单序列重复又称微卫星DNA。它是利用某个 ISSR的引物通常为16~l8个碱基序列,由l~4
微卫星DNA两端的保守序列设计1对特异引物,扩 个串联重复和几个非重复的锚定碱基组成,其引物
增这个位点的微卫星序列,经聚丙烯酰胺凝胶电泳 的特殊性保证了引物与基因组DNA中SSR的5或
显示不同基因型个体在这个位点多态性的一种分子 3末端结合,是可以检测出基因组许多位点差异的
标记技术。它可以检测出复等位的差异,可以用PCR 一 种新兴的分子标记技术。
扩增检测SSR多态性,还可以用SSR作探针检测动 2 几种常用分子标记辅助育种技术优缺点
植物基因组所含的重复序列,常表现为共显性。由于 分子标记辅助育种技术很多,但每一种都有其
它的优点很多,所以在遗传图谱构建、基因定位、品 优点与缺点,正确认识各种技术的优缺点,能够在应
种鉴定、种质资源保存和利用等方面都有非常广泛 用中取长补短,选择最适合的方法。几种常用分子标
的应用嘲 记辅助育种技术优缺点见表1。
表1 几种常用分子标记辅助育种技术优缺点比较
RFLP 呈孟德尔遗传,不受环境影响,标记数量多,试验结果稳定可靠,在RFLP分析需要的DNA量大(5~10 曲,纯度高;试验操作复
遗传上呈现共显性,可以区分纯合基因型和杂合基因型,非等位的杂,周期长;探针具有种属特异性,每一探针能检测的位点
RFI P标记之间不存在上位性效应 少,只能检测内切酶识别位点上的变异,能提供的信息有限
RAPD 与RFLP相比,RAPD技术的优点是效率高,样品用量少,灵敏度 RAPD标记为显性遗传,不能区分纯合基因型与杂合基因
高和特异性强,设计引物不需知道序列信息等 型,且受反应条件的影响很大,结果的稳定性和重复性差
AFLP 具有共显性和显隐性,稳定可靠,重复性好,多态水平最高,检测 对模板反应迟钝,DNA质量要求较高,谱带可能发生错配与
位点最多,操作简便,分子识别率最高,快速高效,无复等位效 缺失,需要同位素检测,对技术要求高,成本较高,试验耗资
应,TM值高,DNA用量少等 较大
SSR 表现多为共显性遗传,遵循孟德尔遗传法则;数量丰富,广泛分 SSR引物具有高度的种属特异性,开发和合成新的SSR引物
布于整个基因组;对DNA数量及纯度要求不高,易于利用PCR 费用高、难度大
检测;试验操作简便,结果稳定,重复性强[31
1SSR 引物设计简单,多态性较RFLP、SSR、RAPD丰富,可重复性和稳 有些ISSR引物可能在特定基 组DNA中没有配对区域而
定性好于RAPD等特点 无扩增产物
3 分子标记辅助育种在水稻育种中的应用 因 一J、 一2回交聚合到两系杂交水稻光温敏核不
3.1主基因的回交转移和聚合 育系培矮64S中,并且筛选得到了10株改良株系,
3.1.1与品质相关基因的转移和聚合。王岩等[5I把中 改良了该系的抗瘟性。
国香稻的alK和fgr等位片段导入明恢63,获得了 阳海宁等[8]利用回交与分子标记辅助选择相结
稻米糊化温度明显降低,胶稠度升高,具有香味,且 合的方法将抗稻白叶枯病基因Xa23导入主栽杂交
心白粒率有所降低的改良品系。刘巧泉等E61~lJ用分子 水稻品种的保持系先B、天B、盟B、龙特甫B和桂B
标记辅助选择育种技术,经回交转育向籼型常规稻 中,获得了稳定的单抗性基因导入系1436份和双抗
品种特青导人优质籼稻(中等直链淀
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