芸薹属紫色酸性磷酸酶12基因家族的分子进化特征研究.pdfVIP

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2018-01-02 发布于广东
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芸薹属紫色酸性磷酸酶12基因家族的分子进化特征研究.pdf

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芸薹属紫色酸性磷酸酶12基因家族的分子进化特征卢坤张凯柴友荣李加纳西南大学农学与生物科技学院，重庆，400716 PHOSPHATASE 摘要芸薹属紫色酸性磷酸酶12(PURPLEACID 12)基因家族的分子进化分析表明该家族成员的密码予偏性高于A￡PAPl2，但成员间不存在显著差异。芸薹属他一些进化相关的指标，如CBI、ENC和FOP也同样具有同样趋势。芸薹属PAPl2基因编码区序列Ka／Ks和Tv／Ts小于1，表明该基因家族成员受纯化选择，不受正向选择的作用。 PAML 向选择的氨基酸位点。其中，M2a模型预测位点中仅有W。。。达到了显著水平，而M8模型预测位点中S川、P。。。、N：。。、L。。。和F。。，达到了显著水平，而W懈达到了极显著水平。甘蓝和白菜融合形成甘蓝型油菜的过程中，芸薹属PAPl2基因家族内部发生了复杂的非等位基因片段形成的嵌合体。而在甘蓝型油菜中，BnPAPl2—4与BnPAPl2—5发生非等位基因片段交换而产生了BnPAPl2—6，表明部分同源非等位基因间的交换是芸薹属基因(组)进化的一个重要方面。关键词生物化学与分子生物学芸薹属紫色酸性磷酸酶分子进化 MolecularevolutioncharacterizationofBrassicaPURPUE TASE fami ACIDPHOSPHA 12(PAP ly 12)gene LuKun KaiChai Li iana J Zhang Yourong of and CollegeAgronomyBiOteChnOlOgy，Southwest AbstractMolecularevolution ofBrassicaPURPLEACIDPHOSPHATASE12 analysis (PAPl2)showedthatcodonbiasofBrassz。caPAPl2are thanAtPAPl2，while geneshigher thereareno differencesthesemembers．GC3andCAIvaluesofBrassica significant among thanthose PAPl2are0．05and0．003～0．015 of genes higher and othercodonbiasindices。suchasCBI，ENCandFOPalsoshowsimilartrend．Ka／Ks Tv／ that Tsof ofBrassicaPAP12 arelowerthan1，suggesting codingregionsequences genes 农业现代化与农业新技术