一种从多表达谱数据挖掘基因共表达团的新方法-生物化学与生物物理.pdf

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一种从多表达谱数据挖掘基因共表达团的新方法-生物化学与生物物理

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2008, 35(8): 9 14~920 种从多表达谱数据挖掘基因共表达团的新方法* 陈兰1,3)** 王世敏1,3)** 陈润生1,2)*** 1) 2) 3) ( 中国科学院计算技术研究所,北京 100 190; 中国科学院生物物理研究所,北京 100 101; 中国科学院研究生院,北京 100049) 摘要 随着近年来高通量基因表达谱数据的涌现,集成多个不同实验条件的表达谱数据,并挖掘在多数据源都保守的基因共 表达团,成为预测基因功能或者调控关系的方法之一 但是,常用的方法通常仅简单地集成不同表达谱数据并推导保守基因 共表达团,这样可能会导致结果中出现并非真正在多数据源保守的共表达团 提出一种结合最小哈希与局部敏感哈希的新方 法,可以高效地寻找在多表达谱数据源 真正保守的基因共表达团 结果分析证明,相比过去的方法,现提出的方法可以获 得更加功能相关和调控相关的基因共表达团 关键词 表达谱,共

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