分子生物学第3章 现代分子生物学_生物信息的传递(上).ppt

自由鸟苷酸的3’-OH作为亲核基团攻击内含子5’端的磷酸二酯键，从上游切开RNA链。 上游外显子的自由3’-OH作为亲核基团攻击内含子3’位核苷酸上的磷酸二酯键，使内含子被完全切开。 图3-31 I类内含子的自我剪接过程 在II类内含子切除体系中，内含子本身的某个腺苷酸2’-OH作为亲核基团攻击内含子5’端的磷酸二酯键，从上游切开RNA链后形成套索状结构。 再由上游外显子的自由3’-OH作为亲核基团攻击内含子3’位核苷酸上的磷酸二酯键，使内含子被完全切开，上下游两个外显子通过新的磷酸二酯键相连。 II类内含子 1.内含子本身的某个腺苷酸2’-OH作为亲核基团攻击内含子5’端的磷酸二酯键。 2.上游外显子的3’-OH作为亲核基团攻击内含子3’位核苷酸上的磷酸二酯键，使套索结构完全解离。 图3-32 II类内含子的自我剪接过程 Ⅱ类内含子的自我剪接 3. 8 RNA的编辑和化学修饰 RNA的编辑（RNA editing）是某些RNA，特别是mRNA的一种加工方式，如转录产物RNA前体编码区发生碱基的突变、插入或丢失等现象，它导致了DNA所编码的遗传信息的改变，经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。 图3-33 哺乳动物载脂蛋白基因转录产物的编辑 载脂蛋白基因编码区共有4563个密码子。在肝脏中，该基因转录产生完整的mRNA并被翻译成有4563个氨基酸的全长蛋白质，相对分子质量为5.1×105。在肠中合成的却是只包含有2153个密码子的mRNA，翻译产生相对分子质量为2.5×105的蛋白质。 研究发现，该蛋白其实是全长载脂蛋白的N端，它是由一个在序列上除了2153位密码子从CAA突变为UAA之外完全与肝脏mRNA相同的核酸分子所编码的，C→U突变使编码谷氨酰胺的密码子变成了终止密码子。 RNA的编辑虽然不是很普遍，但在真核生物中却时有发生（表3-13）。 大鼠脑中谷氨酸受体蛋白mRNA经编辑后，多个编码谷氨酸的密码子变成了在控制通过神经递质的离子流过程中有重要影响的精氨酸，表明RNA的编辑可能是充分发挥生理功能所必须的。 表3-13 哺乳动物中RNA编辑的实例 组织 靶标RNA 所改变 的 碱基 结果 肝脏，肠 载脂蛋白B C→U 谷氨酰胺密码子→终止 子 肌肉 半乳糖苷酶 U→A 苯丙氨酸密码子→酪氨 酸 睾丸，肿 瘤等 肿瘤 Wilms肿瘤基 因-1 神经纤维瘤基 因-1 U→C C→U 亮氨酸密码子→脯氨酸 精氨酸密码子→终止子 脑 谷氨酸受体蛋 白 A→I 多个谷氨酸密码子→精 氨酸 RNA编辑的另一种形式是尿苷酸的缺失和添加。研究发现，利什曼原虫属细胞色素b mRNA中含有许多独立于核基因的尿嘧啶残基，而特异性插入这些残基的信息来自指导RNA（guide RNA）。 指导RNA与被编辑区及其周围部分核酸序列虽然有相当程度的互补性，但该RNA上存在一些未能配对的腺嘌呤，形成缺口，为插入尿嘧啶提供了模板（图3-34）。反应完成后，指导RNA从mRNA上解离下来，而mRNA则被用做翻译的模板。 图3-34 指导RNA和RNA的编辑机制 RNA的编辑的生物学意义 （1）校正作用 有些基因在突变过程中丢失的遗传信息可能通过RNA编辑得以恢复。 （2）调控翻译 通过编辑可以构建或去起始密码子和终止密码子，是基因表达调控的一种方式。 （3）扩充遗传信息 能使基因产物获得新的结构和功能，有利于生物进化。 除了RNA的编辑之外，有些RNA，特别是前体rRNA和tRNA，还可能有特异性化学修饰。 图3-35是最常见的6大类化学修饰途径及其产物。研究证实，仅人细胞内rRNA分子上就存在106种甲基化和95种假尿嘧啶产物，虽然尚未发现特征性保守序列，但有实验证据表明，RNA的化学修饰可能具有位点特异性。 3.8.3 RNA的化学修饰 硫代 用硫取代碱基分子上的氧 碱基环结构上发生分子替代 二价键的饱和化 核苷酸的替代 用不常见核酸替换常见核苷酸 去氨基化 从碱基上去掉氨基 甲基化 在核苷酸的碱基或核糖 基上加一个或多个-CH3 碱基同分异构化， 使二价键饱和 图3-35 rRNA和tRNA分子中的核苷酸化学修饰 有实验表明，分子量只有70-100个核苷酸的核仁小RNA（snoRNAs）参与RNA的化学修饰，因为这些RNA能通过碱基配对的方式，把rRNA分子上需要修饰的位点找出来（图3-36）。snoRNA上的D盒是甲基化的识别位点 图3-36 酵母U24 snoRNA指导的甲基化 1