遗传距离聚类法和模型聚类法在地方鸡种群体遗传结构-畜牧兽医学报.PDF

畜牧兽医学报 ， （ ）： １４６０１４６５ 　 犃犮狋犪犞犲狋犲狉犻狀犪狉犻犪犲狋犣狅狅狋犲犮犺狀犻犮犪犛犻狀犻犮犪 遗传距离聚类法和模型聚类法在地方鸡种群体 遗传结构分析中的比较 １ １ １ １ １ ２ １ １ 李慧芳 ，陈宽维 ，韩 威 ，张学余 ，高玉时 ，陈国宏 ，朱云芬 ，王 强 　 　 （ 中国农业科学院家禽研究所，扬州 ； 扬州大学动物科学与技术学院，扬州 ） １． ２２５００３２． ２２５００９ 摘 要：利用 个微卫星标记，计算品种间 遗传距离和基因流（ ），并基于 遗传距离运用 算法和基 １６ 犇犃 犖犿 犇犃 ＮＪ 　 于 程序构建 类聚类图，比较分析 个地方鸡品种群体间的遗传结构和亲缘关系。结果表明：基于 Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ２ １０ 犇犃 遗传距离运用 算法构建的聚类图将 个地方鸡品种总体上分为 大类：轻体型的鸡种（包括茶花鸡、藏鸡、仙 ＮＪ １０ ２ 居鸡、固始鸡和白耳鸡）和重体型的鸡种（包括狼山鸡、大骨鸡、北京油鸡、鹿苑鸡和萧山鸡）；在轻体型的类别中，茶 花鸡和藏鸡、仙居鸡和固始鸡聚为一类；在重体型的类别中，鹿苑鸡和萧山鸡聚为一类，狼山鸡、大骨鸡和北京油鸡 则表现为独立分支，聚类结果与品种间基因流动相一致。Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ程序在预先未标识个体品种来源的条件下，准 确推断出 个地方鸡种群体所属类别，构建的聚类图与遗传距离聚类结果基本一致。 程序还根据个体 １０ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ 基因组分数，指出了 个地方鸡种群体中迁移个体和具有复杂遗传基础个体的分布，这是遗传距离聚类法所不能 １０ 揭示的。 关键词：微卫星；地方鸡品种；遗传距离聚类法；模型聚类法 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） Ｓ８１３．２ Ａ ０３６６６９６４２００８１１１４６００６ 　　　　 　　　　 犆狅犿 犪狉犲犱犃狀犪犾狊犻狊狅犳犌犲狀犲狋犻犮犛狋狉狌犮狋狌狉犲犪犿狅狀 犆犺犻狀犲狊犲犐狀犱犻犲狀狅狌狊犆犺犻犮犽犲狀 狆 狔 犵 犵 犅狉犲犲犱狊犝狊犻狀 犇犻狊狋犪狀犮犲犫犪狊犲犱犪狀犱犕狅犱犲犾犫犪狊犲犱犕犲狋犺狅犱狊 犵 １ １ １ １ １ ， ， ， ， ， ＬＩＨｕｉｆａｎ ＣＨＥＮＫｕａｎｗｅｉ ＨＡＮＷｅｉ ＺＨＡＮＧＸｕｅｕ ＧＡＯＹｕｓｈｉ ｇ