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摘 要
本论文工作结合分子微生物生态学方法和传统的培养方法对太平洋帕T.
西维拉 (PareceVela)海盆5010米深处的底泥样品进行了细菌多样性分析,同
时完成了菌株PhotobacteriumXX的鉴定工作。
应用分子微生物生杰学的方法提取环境总DNA,通过细菌特异性PCR扩
增和连接转化,得到分布于17个不同类群的32个大于1.4kb的细菌16SrDNA
克隆序列,其中5个序列归属于Proteobacteria的Alpha亚群,20个序列归属于
Proteobacteria的 Gamma0群,7个序列归属于海洋非培养类群,归属于
Pseudoalteromonas属的序列在总克隆子中所占比例最大,是优势类群。
利用培养的方法从该样品中获得了132株低温细菌,其形态和生理11:化等
特征表现出丰富的多样性。对其中最适生长温度小于20℃的29株细菌进行了16S
rDNA序列的分析,结果表明,该类:细菌分为 10个不同的类群,归属于
Proteobacteria的 Gamma亚群和革兰氏阳性细菌,其中 55%的序列属于
Pseudoalteromonas属,在该类群中占优势地位。
对Photobacterium属的菌株DI和D2进行了鉴定。两个菌株16SrDNA
序列同源性为99%,DNA杂交率为90%a拟建立新种PhotobacteriumXXoDI
和D2为不规则形状,革兰氏阴性细菌,G+C%为41-42·对菌株D2脂肪酶粗酶
进行了初步研究,发现其最适反应温度在40C,最适反应pH值为8.0a
关键词:深海 细菌生物多样性 分子微生物生态学 低温细菌
Abstract
XieHua(Microbiology)
Directed场ProfMaYanhe
Inthisstudy,thebacterialdiversityofthedeep-seasedimentinPareceVelaBasin,
PacificOcean,atthedepthof501Omwasanalyzedbyusingbothofthemolecular
microbialecologyapproachandthetraditionalculturemethod.Novelspecies
PhotobacteriumXXwasproposed.
TheenvironmentaltotalDNAwasdirectlyextractedrfom thedeep-seasample
accordingtothemolecularmicrobialecoloevaunroach.Bacterial16SrDNAwere
am orinea ov rc;x.wrcerm e.rt;i Droauctswere cionea.St nacieriai.log rUNE1
sequencesaiviaeanitoitairrerentgroupswimaienginormoretnan1.4Kb were
acquired;ofwhich5sequencesbelongedtoa-Proteobacteria,20sequencesbelonged
to ti-rroreonacierta ana me-orner isequences oeronaea to m e marnie tmcurturea
bacteria.Jequencesbelonging to the.genusrseuttoatteromonas,whichwasthe
dominanttypeinthesampleaccountedforthelargestportion,about25%ofthetotal
sequences.
132psychrotolarentbacterialstrainswereisolated,whichhadgotdiversephenotypic
physiologicalandbiochemicalcharacteristics.Theanalysisof16SrDNAsequences
of29isolateswiththeoptimalgrowthtemperaturebelow200Cshowedthatthese
isolatescouldbedivid
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