matK序列作为DNA条形码在中药鸡骨草中的应用研究.pdfVIP

matK序列作为DNA条形码在中药鸡骨草中的应用研究.pdf

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132 广东农业科学 2013年第 2期 matK序列作为DNA条形码在中药鸡骨草中的应用 王晓明,姬可平 ,牛宪立 ,魏妮娜 (遵义医学院珠海校区 ,广东 珠海 519041) 摘 要 :采用改 良的CTAB法提取来 自不同地区的9种 中药鸡骨草的总DNA,利用豆科植物通用引物对matK序列进行PCR 扩增,将扩增得到的序列提交到GeneBank中获得登录号。最后将所有序列进行聚类分析,计算种问及种内遗传距离 .建立系统发 育邻接树。结果表明,matK序列的全长为 889~895bp;不同植物之间的遗传距离较大,同种植物之间的遗传距离较小 ,且最大的种 内遗传距离小于最小的种间遗传距离。因此,matK序列可以作为豆科植物的DNA条形码 关键谰 :matK序列:DNA条形码:鸡骨草 中图分类号 :Q341 文献标识码 :A 文章编号:1004—874X(2013)02—0132—03 matK sequenceusedasDNA barcodeapplied inChineseherbAbruscantoniensis WANGXiao—ming,JIKe-ping,NIUXian-li,WEINi-na (ZunyiMedicalCollege ZhuhaiCampus,Zhuhai519041,China) Abtract:W egottheDNA from ninedifferentAbrus cantoniensiswhich grow inGuangdongand Guangxiprovincebyusing the modifiedCTAB method.InordertogetninekindsofAbrus cantoniensisITSsequences,weamplifiedtherDNA internaltranscribed spacerregion (ITS)sequencesbyusinguniversalprimersthroughPCR,aswellasregisteredtoGenBankandgottheaccessionnumber. Finally,allsequenceswereanalyzedusingtheclusteranalysistocalculateinterspecificand intraspecificgeneticdistanceforestablishing phylogeneticadjacenttree.TheresultsshowedthatthetotallengthofthematKsequencewas889~895bp.Geneticdistancecalculation resultsshowed thatthegeneticdistancebetween differentplantspecieswaslarge,and thegeneticdistancebetween the sameplant specieswassmal1.However,themaximum intraspecificgeneticdistancewassmallerthan theminimum interspecificgeneticdistance. Therefore,thematK sequencecouldbeusedasDNAbarcodeofFabaeeae. Keywords:matK sequence;DNAbarcode;Abrus cantoniensis 中药鸡骨草 (Abruscantoniensis)主要包括药典里记 1 材料与方法 载的鸡骨草和民间的习用品毛鸡骨草 ,两种都属于豆科 相思子属植物

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