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蛋白质的构件--氨基酸

氨基酸等电点的计算公式可分为下列情况: 1. 非极性R基氨基酸和不带电荷的极性R基氨基酸(半胱氨酸除外):pI = (pKa1 + pKa2 )/2 2.带负电荷的极性R基的氨基酸(酸性氨基酸):pI = (pKa1 + pKR-COO- )/2 半胱氨酸(Cys)不属酸性氨基酸,但其—SH具有弱酸性,在PH7.0时, Cys的—SH部分解离,故其PI按酸性氨基酸计算。 3.带正电荷的极性R基的氨基酸(碱性氨基酸):pI = (pKa2 + pKR-NH2 )/2 例如:Glu的pKa1=2.19, pKa2= 9.67 , pKR= 4.25 ,计算其等电点? 解:根据等电点的定义,近似求出 pI=(pKa1+pKR)/2=(2.19+4.25)/2=3.22 六、氨基酸的化学性质 1、ɑ-氨基参与的反应 (1)与甲醛发生羟甲基反应 氨基酸的氨基被羟甲基化后,碱性下降,可用酚酞作为 滴定的指示剂,来测定氨基酸的浓度。 (2)与亚硝酸反应 R CH COOH NH3 + HNO2 R CH COOH OH + N2 + H2O 产生的氮气一半来自氨基酸,另一半来自亚硝酸,可测定氮气的体积计算氨基酸的量(Van Slyke法) (3)酰化反应 R1-C-X + H2N-CHCOO- O R2 OH- R1-C-HN-CH-COO- O R2 X=Cl, OCOR 氨基酸酰化产物 R1-C-OH + H2N-CH-COO- O R2 DCC R1-C-HN-CH-COO- O R2 (4)烃基化反应 亲核 ② 与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应 (5)生成西佛碱的反应 E-NH2 + O=C CH2OPO32- CH2OH + H+ E-N=C + H CH2OPO32- CH2OH + H2O 酶活性中心 磷酸二羟丙酮 质子化西佛碱 (6)脱氨基和转氨基反应 R-CH-COO- NH3+ R-C-COO- O + NH4+ -OOCCH2CH2-CH-COO- + CH3-C-COO- NH3+ O -OOCCH2CH2-C-COO- O + CH3-CH-COO- NH3+ 氧化酶 谷丙转氨酶 α-酮酸 谷氨酸 丙酮酸 2、α-羧基参与的反应 (1)成盐反应 R—CH—COOH + NaOH NH2 R—CH—COONa +H2O NH2 (2)成酯反应 R—CH—COOH + C2H5OH NH2 HCl气 R—CH—COOC2H5 NH2.HCl 当羧基变成乙酯后,羧基的化学性质就被掩蔽了,而氨基的化学性质就突出地显示出来。 (3)形成酰卤的反应 Y—NH—CRH—COOH + PCl5 Y—NH—CRH—COCl 酰化氨基酸 酰化氨基酰氯 使氨基酸的羧基活化,易于另一氨基酸的氨基结合,在合成肽的工作上常用。 Y:保护基,可为酰基 (4)叠氮反应 H2N-CHR-COOH YHN-CHR-COOH YHN-CHR-COOCH3 酰化氨基酸 酰化氨基酸甲酯 NH2NH2 (-CH3OH YHN—CHR—CO—NH—NH2 酰化氨基酸的肼衍生物 氨基酸的叠氮衍生物常作为多肽合成的活性中间体 (5)脱羧反应 H2N—CHR—COOH 脱羧酶 CO2 + RCH2NH2 胺 GABA是一种抑制性神经传导物质,缺乏容易导致紧张焦虑,易发于高压人群中! 3、α-氨基和羧基共同参与的反应 (1)茚三酮反应:氨基酸可与茚三酮缩合产生蓝紫色化合物,最大吸收峰在570nm。该反应可作为蛋白质定性、定量分析的基础。 (2)成肽反应 + -HOH 甘氨酰甘氨酸 肽键 4、侧链基团的化学性质 (1)巯基的性质 A、弱酸性 B、与卤代烃发生反应,生成烃基衍生物 C、络合反应 D、形成二硫键 E、与DTNB反应 F、被氧化成磺基丙氨酸 -OOC-CH-CH2-SH- NH3+ C6H5CH2OCOCl C6H5CH2Cl ICH2CONH2 -OOC-CH-CH2-S-COOCH2C6H5 NH3+ -OOC-CH-CH2-S-CH2C6H5+HCl NH3+ -OOC-CH-CH2-S-CH2CONH2 NH3+ 与卤代烃反应,生成稳定的烃基衍生物 氧化还原反应 络合反应 COO- Hg+ HO- Cys CH2SH Cys CH2S COO- Hg+ 与DTNB(硝基苯甲酸二硫化合物)反应 H3+NCHCH2S- + COO- S S CO2H NO2 CO2H NO2 H3+NCHCH2S-S COO- CO

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