罗非鱼源无乳链球菌S-核糖基高半胱氨酸酶基因（1uxS）的克隆及其推导蛋白的三维结构预测研究.pdfVIP

第9卷第 1期 南 方 水 产 科 学 Vo1．9．No．1 2013年 2月 SouthChinaFisheriesScience Feb．．2013 doi：10．3969／j．issn．2095—0780．2013．01．007 罗非鱼源无乳链球菌 S一核糖基高半胱氨酸酶基因(1uxS)的 克隆及其推导蛋 白的三维结构预测 马艳平，李嘉彬，郝 乐，刘振兴，冯国清，周结珊，柯 浩 (广东省农业科学院兽医研究所 ，广东省兽医公共卫生公共实验室 ，广东 广州 510640) 摘要：利用PCR技术对罗非鱼源无乳链球菌(Streptococcusagalactiae)S-核糖基高半胱氨酸酶 (1uxS)基因全长DNA 进行了扩增 、克隆和序列测定，采用ExPAsy软件包预测了推导蛋白的特性 ，利用SwisS—Model服务器建立了luxS 三维结构，利用 SwisS—PDBviewer软件进行了蛋白质三维结构的分析。预测结果显示，罗非鱼源无乳链球菌 luxS 推导蛋白包括保守的酶活性中心和锌结合位点，具有影响生物被膜形成、毒力因子调控等特性功能；经拉氏构 象图(Ramachandranplot)分析 ，所构建的zs的空间结构合理。 关键词：罗非鱼 ；无乳链球菌 ；S-核糖基高半胱氨酸酶；三维结构 中图分类号 ：S941．42 文献标志码：A 文章编号 ：2095—0780一(2013)O1—0043—05 CloningofStreptococcusagalactiaeluxS genefrom tilapia and3D structurepredictionofdeducedprotein MAYanping，LIJiabin，HAO Le，LIUZhenxing，FENGGuoqing，ZHOUJieshan，KE Hao (GuangdongPublicLab．ofVeterinaryPublicHealth，InstituteofVeterinaryMedicine，GuangdongAcademyof AgriculturalSciences，Guangzhou510640，China) Abstract：Wehaveamplified，clonedanddeterminedthesequenceofStreptococcusagalactiaeluxSgenefrom Tilapia sp．byPCR． ThecharacteristicsofthededucedluxSproteinwerepredictedbyExPAsysoftware；the3D structuresofluxSandthededucedprotein wereestablishedand analyzedbySWISS-ModelandSwisS—PDBviewersoftware，respectively．Theresultsindicatethatthededuced luxSproteincontainsconservedactivecenterandZn“bindingsite，whichmayaffectbiofilm formationandregulateviurlencefactor ． TheRamachandram plotshowsthatthesturctureofmodeledluxSproteinisreasonable． Keywords：Tilapiasp．；Streptococcusagalactiae；luxS；3D sturcture 细菌能产生一种 自体诱导物 (autoindu