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梨S基因PCR扩增体系的优化
齐国辉徐继忠 张玉星王国英
(河北农业大学,保定071000)
摘要:通过对梨S基因PCR扩增反应程序中的重要参数进行梯度试验,建立了梨S基因
PCR
PCR扩增最佳反应体系:即在20/zl反应体系中,10XBuffer2.0/A,25mMMgCl22.0/A
(2.5raM),2.5mM DNA
Taq
聚合酶0.2止(1U),模版DNA30ng,补灭菌重蒸水至20/A。
关键词:梨;S基因,PCR扩增,反应体系
在配子体自交不亲和系统中,不亲和性主要是由单个基因座上的S复等位基因控制
的[1I,确定植物自交不亲和基因型是当前自交不亲和研究的重点。确定果树S基因型传统的
Komori等rz]用杂交的
方法是通过杂交后坐果率的调查或观察花粉管的生长来进行。Sadao
方法确定了9个苹果品种的S基因型;寺兄魔雄等[3]用这种方法鉴定了一些梨品种的S基因
型,但这种方法耗物费时,使得果树品种S基因型的鉴定工作进展缓慢。近年来,随着分子
生物学研究的不断深入,一些先进手段不断用于果树品种S基因型的鉴定,如应用花柱可溶
性蛋白的等电聚焦电泳及分子标记技术等,鉴定出一些梨品种的S基因型[4~5]。最近又发现
的系统,即用具有单一识别位点的限制性核酸内切酶消化PCR扩增片段,然后根据核酸内
鉴定出S基因型的梨品种中,以日本梨居多,中国梨品种的§基因型鉴定则刚刚起步口0I,
因此急需加大力度进行研究。
本文摸索了梨S基因PCR扩增体系的优化条件,.以便为高效扩增S基因奠定基础。
1材料与方法
1.1材料
1.1.1植物材料
(S5S6)、长寿(S1S5)[1
210梨科研与生产进展(三)
嫩叶,用冰盒带回实验室,--40℃冰柜中保存。
1.1.2酶、试剂
Taq
Rnase
Marker为MSM34(100bp+1.5kb)DNALadder,系上海生工公司产品;其他试剂均为超
纯或分析纯。 ’。
1.1.3PCR引物
WPNV”分别设计正向引物P1
根据s1一,RNase基因保守序列“FTQQYQ”和“anti-1I
和反向引物P2[sI,引物由上海生工生物工程有限公司合成。
引物序列分别为:
P1:5’一TTTACGCAGCAATATCAG一3’
P2:5’一AC(A/G)TTCGGCCAAATAATT一3’
1.2试验方法
1.2.1基因组DNA的提取和纯化
采用改良的CTAB法[13|,纯化后的DNA用适量TE溶解,--20℃保存。
1.2.2DNA浓度和纯度检测
Uv_VIS
8500分光
将提取的DNA用0.8%的琼脂糖凝胶进行检测,然后用Techcomp
合要求。DNA浓度(pg/p1)一OD260×50×稀释倍数/1000。
1.2.3梨争基因PCR反应体系的建立
、
梨孓基因PCR反应体系的建立中主要进行以下试验:
Buffer MgCl2
一基本反应体系为(20/卫1):10×PCR2.o弘1,20mM 1.6p1,2.5mM
Taq
dNTPl.6弘l,5pM引物各3.0pl,5U/pl
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