王镜岩生物化学讲义 1蛋白质2.ppt

第一章 蛋白质;特点：含氮量较恒定，一般在16%左右 蛋白质系数——6.25 蛋白质含量 = 样品含氮量?6.25;第二节 氨基酸;中文：如 甘氨酸； 英文：三字母符号（Gly）和单字母符号（G）;3.稀有氨基酸：蛋白质合成后在基本氨基酸基础上经加工修饰而生成的氨基酸。;二、必需氨基酸（8种）： 人体不能自我合成，必须从外界中摄取的氨基酸;NH3?—CH2—CH2—CH2—CH2—;三、氨基酸的理化性质;等电点定义：某一氨基酸的净电荷等于零时的溶液pH值为该氨基酸的等电点 不同的氨基酸有不同的等电点 等电点时的特点：溶解度下降 用途：可根据氨基酸的等电点来分离不同氨基酸，如味精生产时将pH值调到3.22，谷氨酸沉淀下来。;pI计算法： pI=（pK左′+pK右′ ）/2 pK左′ : pI处左侧pK ′值， pK右′ :pI处右侧pK ′值。 如：甘氨酸的两性解离为：;赖氨酸的两性解离为：;3. 吸收光谱： 所有20种基本氨基酸在可见光区都无光吸收，在近紫外区三种芳香氨基酸具有紫外吸收， 即：苯丙氨酸—257nm、 酪氨酸—275nm、 色氨酸—280nm;氨基酸表观解离常数和等电点; 用途：可用于氨基酸的定性和定量测定 脯氨酸是亚氨基酸，只有一步反应，反应产物为黄色。;（2）Sanger反应 氨基酸与二硝基氟苯（DNFB）反应，生成二硝基苯代氨基酸（DNP—氨基酸）;（3）Edman反应 异硫氰酸苯酯与氨基酸反应生成PTH—氨基酸; 5.氨基酸的分离方法 （1）分配层析 固定相，流动相;样品1;第三节 肽;由于有巯基，所以有氧化还原反应 GSH + GSH ? GS—SG + 2H+ +2e- 谷胱甘肽是生物体内重要的氧化还原物质，对细胞起到了保护作用，另外，还是其他细胞保护剂的还原剂;;第四节 蛋白质结构;?;二面角— ?和?两个构象角称为二面角;非键合原子之间最小接触距离 （nm）; a－螺旋：要点：单链、右旋，一圈3.6残基，上升0.54nm，形成5→1氢键且全部平行，R－基指向外侧;?－折叠：肽链伸展，形成链间氢键（成为片层），R-基处于片层上下;反平行b－折叠;? －转角（回折）：肽链180°旋转，氢键连接；;卵溶菌酶;三、超二级结构：概念：相邻二级结构单元 相互作用形成的聚合体;四、结构域：概念：蛋白质分子中在空间相对独立的三维实体。;例：肌红蛋白。是肌肉中运输氧的蛋白质，一条肽链，153个氨基酸残基，分子量为16700，含一个血红素辅基，氧分子就结合在它的铁上。整个分子有8个?-螺旋，并且有?-转角和无规则卷曲，但是无?-折叠 。;特点： ① 高低不平;③ 外亲内疏;如：血红蛋白含有四个亚基，为?2?2，每个亚基含一个血红素，每个血红素可结合一个氧分子。?亚基含141个氨基酸残基，?亚基含146个氨基酸残基。; 氢键、盐键、疏水作用力、二硫键、配位键、范德华引力 ;;;;;;;;;;一、蛋白质的变性 二、氨基酸序列规定蛋白质的三维结构 　　　一级结构与空间结构的关系 三、蛋白质结构预测 ;蛋白质结构和功能预测??? DNA序列的测序速度,远远超过测定蛋白质三维结构的进展。因此,如何从蛋白质序列甚至由DNA读框翻译出的氨基酸序列预测可能的蛋白质结构,就成为迫切的任务。目前较为有效的预测方法,都要依靠已知三维结构的蛋白质的序列来预测折叠单元。基于轮廓(profile)的预测方法,通常假定两段被比较的蛋白质序列的氨基酸残基接近水环境的情形是保守的。另一种所谓“线串法”(threading)则同时考虑单个残基的环境和一定距离内双残基的相互作用,因而效果较好。; ;预测的 BTI 二级结构;预测的 BTI 三级结构;一、蛋白质的功能：催化、运转、运动、能量交换、免疫、激素、调节、结构、贮存 二、一级结构与功能的关系：一级结构与功能有密切的关系 P181-189 1. 氨基酸对功能的重要性 如果改变的氨基酸是蛋白质执行功能所必需的，则这种氨基酸的改变对功能的影响极大，如果改变的氨基酸对功能无贡献，则它们的改变基本不影响蛋白质的功能。 如RNA酶，如果将其N-端的三个氨基酸去掉，酶的功能基本不变，但是，如果将组12改变，则酶失去活性。 ;镰刀状贫血病：就是由于血红蛋白?-链上第六位的谷氨酸被缬氨酸代替，使得血红蛋白分子在氧分压低的情况下容易聚