生化-核酸的化学.ppt

限制性内切酶 DNA二级结构特点归纳 两条反向平行多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕 嘌呤与嘧啶碱基在内侧，碱基平面与纵轴垂直，磷酸与核糖在外侧，糖环平面与纵轴平行，右手螺旋 双螺旋平均直径为2nm，碱基堆积距离为0.34nm，相邻两核苷酸间夹角为36°，螺距为3.4nm 两条链按A=T和G三C碱基配对，由疏水作用和氢键维系在一起，由一条链通过碱基互补决定另一条链。 DNA双螺旋与蛋白质α-螺旋的比较 参数名称 DNA 蛋白质α-螺旋 提出人、年份 美国Pauling和R.B.Corey,1951年 J.D.Watson和F.H.C.Crick，1953年 直径 2nm 螺距 3.4nm 0.54nm 每个单位上升的距离 0.34nm 0.15nm 每个单位绕纵轴的角度 36 ° 100° 每个螺旋所需的单位数 10 3.6 DNA的多种立体构象 三股螺旋 DNA的三级结构 核蛋白＝DNA－蛋白质复合物 四、DNA和基因组 （一）DNA与基因 基因：遗传学中DNA分子中最小的功能单位。 结构基因：为RNA或蛋白质编码的基因。 调节基因：只有调节功能而不转录成RNA的片段。 基因组：某生物体所含的全部基因。 原核基因组的特点 1、除调节序列和信号序列外，DNA的大部分是为蛋白质编码的结构基因，而且每个基因在DNA分子中只出现一次或几次。 2、功能相关的基因常常串联在一起，并转录在同一mRNA分子中。 ３、有基因重叠现象。这种现象主要存在于病毒DNA分子中。可能是DNA分子太小而又要装入相当数量的基因的缘故。如φX174的E基因全部包在D基因内，而B基因则全部包在A基因内。 真核基因组的特点 1、有重复序列，根据重复次数多少可分为 单拷贝序列：在DNA分子中只出现一次或几次。 中度重复序列：重复几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质基因。 高度重复序列：可重复几百万次。一般位于异染色质上，不编码蛋白质或RNA，可能与染色体结构的形成及基因表达调控有关。 ２有断裂基因(split gene) 内含子（intron）：不编码，有称居间序列。功能尚不清楚，可能含有调节信号，或将基因分割成可交换的单位，以便生物进化中重新组合构成新的基因。 外显子(exons)：编码。 真核基因中的断裂基因和内含子、外显子 五、RNA的结构与功能 RNA分子通常是DNA片段转录生成的，因此，RNA分子要比DNA分子小得多。 RNA种类多样，如tRNA、mRNA、rRNA等。 tRNA中稀有碱基丰富，约占10%。 原核生物的mRNA是多顺反子，多个基因转录到一条mRNA上，编码多条肽链。 真核生物的mRNA是单顺反子，一个基因转录到一条mRNA上，编码一条肽链。 真核生物的mRNA具有5′端帽子结构和polyA尾巴。 RNA还有催化、调控等功能。 tRNA高级结构 六、核酸的性质——核酸的非特异性水解 核酸分子中的磷酸二酯键可被酸碱水解 DNA和RNA对酸或碱的耐受程度有很大区别。在0.1mol/L溶液中RNA几乎可以被完全水解，DNA在同样条件下不受影响。 酸易水解N-糖苷键，嘌呤碱基比嘧啶碱基容易被水解。DNA的嘌呤碱基在pH2以下脱落形成无嘌呤酸。 碱更容易水解RNA的磷酸酯键，这与RNA核糖所连接的2′-OH的相邻基团有关。RNA水解时2′-OH首先进攻磷酸基，断开磷酸酯键的同时形成环状磷酸二酯，再在碱的作用下形成水解产物。 核酸的特异性水解——酶解 核酸酶的分类 按底物专一性分：RNsae和DNase 按作用方式分：核酸内切酶和核酸外切酶 按作用键分：3′-磷酸酯键水解酶和5 ′-磷酸酯键水解酶 N-糖苷酶：水解糖苷键，产物为含氮碱基和无碱基的寡核苷酸。 第二章 核酸的化学 第一节 核酸的概念和重要性 第二节 核酸的组成成分 第三节 DNA的结构 第四节 DNA和基因组 第五节 RNA的结构与功能 第六节 核酸的性质 第七节 核酸的序列测定 第一节 核酸的概念——核酸的发现 1868-69 F.Miescher从脓细胞核中提取出含磷量高的酸性物质。其后从鲑鱼精子中提取到鱼精蛋白和核素。 1885 O.Hertwig提出核素可能负责受精和遗传。 1889 R.Altmann从酵母和动物组织中提取出不含蛋白质的核酸。 1894 A.Kossel和A.neumann从胸腺中提取核酸，证明胸腺核酸与酵母核酸不同。O.Hammars证明酵母核酸中的糖是戊糖。 1902 E.Fischer研究糖和嘌呤获诺贝尔化学奖。Kosser 等鉴定核酸中的嘌呤和嘧啶。 1909 P.A.Levene等鉴定核酸中的D-核糖。 1910 Kosser 因核酸化学中的研究获诺贝尔生理学奖。 1912 P.A.Levene等认为核酸由四种核苷