核酸适体活性评价标准操作规范国家标准-中国标准化研究院.DOCVIP

ICS07.080 B 20/39 中华人民共和国国家标准 GB/T XXXXX—2017 核酸适体活性评价标准操作规范 General technique rules for activity evaluation of aptamer 点击此处添加与国际标准一致性程度的标识 - XX - XX发布 XXXX - XX - XX实施 前言 本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规划起草。 本标准由中国标准化研究院提出并归口。 本标准起草单位：河北食品检验研究院等 本标准主要起草人： 核酸适体活性评价标准操作规范 范围 本标准规定了核酸适配体与靶标结合的亲和力和特异性的评价，确立核酸适配体与靶标结合的专一性和选择性的方法验证，建立性能评价的。 本标准适用于针对等不同层次靶标体系的核酸适配体。/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 SN/T 1193 基因检验实验室技术要求 术语和定义 核酸适配体( Aptamer) 能够与多种目标物（蛋白、药物、金属离子、无机或有机分子、细胞、组织）发生高亲和性和特异性结合的一类单链核苷酸（DNA或RNA）分子。 平衡解离常数(disocciation constant，Kd) 是靶标物质被核酸配体结合一半时靶标物质的浓度常数。 操作步骤 核酸适配体与靶标的结合能力分析方法 测定筛选获得核酸适配体与靶标结合的平衡解离常数（Kd），Kd值越小表明两者相互作用越强。 Kd常用测定方法： 荧光光谱法：适用于细胞，大分子，小分子，复杂靶标等。对核酸适配体进行荧光标记，稀释到不同浓度，与相同浓度的靶标共混并在合适的条件下孵育，将结合后的靶标与未结合的核酸适配体分离，使用荧光光谱仪测定核酸-靶标复合物的荧光强度，绘制荧光强度与核酸适配体浓度的关系图，拟合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer])，获得Kd值。 流式细胞术：适用于细胞、大分子、小分子等。对核酸适配体进行荧光标记，释到不同浓度；与相同浓度的靶标共混并在合适的条件下孵育，将核酸-靶标复合物通过流式细胞仪，测定带有荧光标记的核酸-靶标复合物的数量，绘制其与核酸适配体浓度的关系图，拟合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer])，获得Kd值。 表面等离子共振法：适用于细胞、大分子、小分子等。将核酸适配体固定于芯片上，稀释靶标到不同浓度，加入不同浓度梯度的靶标在合适的条件下孵育后清洗，通过表面等离子共振法设备测定核酸适配体结合的靶标的数量，绘制其与靶标浓度的关系图，拟合η=Bmax/(1+Kd/[Target])，获得Kd值。 等温滴定微量热法：适用于大分子、小分子等，将核酸适配体和靶标进行透析处理，选择适宜的样品浓度，脱气处理后，进行核酸适配体-靶标滴定试验，同时进行对照实验（滴水试验，样品滴定缓冲溶液试验），所得数据经过软件分析即可得到Kd值。 酶联适配体分析法：适用于细胞等，将核酸适配体固定于基板上，洗脱后加入不同浓度梯度的靶标，孵育后冲洗，再加入带有荧光标记的核酸适配体孵育后洗脱，通过荧光分析仪获得荧光强度，绘制荧光强度与靶标浓度的关系图，拟合η=Bmax/(1+Kd/[Target])，获得Kd值。 DNA捕获元件法：适用于细胞、大分子、小分子等。将标记荧光集团和淬灭集团的核酸适配体与不同的浓度靶标混合，孵育后，检测荧光强度。绘制荧光强度与靶标浓度的关系图。拟合η=Bmax/(1+Kd/[Target])，获得Kd值。 生物膜干涉法：适用于：细胞、大分子、小分子等。将核酸适配体固定于芯片上与不同的浓度靶标混合，孵育后清洗，利用生物膜干涉设备测定与核酸适配体结合的靶标数量，绘制其与靶标浓度的关系图，拟合η=Bmax/(1+Kd/[Target])，获得Kd值。 超滤法：适用于细胞、大分子等。对核酸适配体进行荧光标记，释到不同浓度；与相同浓度的靶标共混并在合适的条件下孵育，使用超滤膜过滤，使用荧光光谱仪测定核酸-靶标复合物的荧光强度，绘制荧光强度与核酸适配体浓度的关系图，拟合η=Bmax/(1+Kd/[Aptamer])，获得Kd值。 核酸适配体与靶标结合特异性验证 基于4.1的结果选择亲和力最高（即Kd值最低）的核酸适配体进行特异性验证。选择靶标和几种靶标的结构类似物进行测试，使用4.1中介绍的方法分别测量核酸适配体与靶标以及几种结构类似物的亲和力（即Kd值）并进行比较，获得特异性结果。 防污染措施 检测过程中防止交叉污染的措施按照GB/T 27403中的规定执行。 _________________________________ GB/T XXXXX—2017 1