临床医学知识ー表现活用.pdf

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临床医学知识ー表现活用

臨床医学知識のオントロジー表現と活用 東京大学大学院医学系研究科 大江和彦 kohe@hcc.h.u-tokyo.ac.jp 1.はじめに 診療の場で発生するいろいろな情報の電子化がすすんでおり、電子カルテシステムの導入により、 処方箋の内容や画像、数値の検査結果だけでなく、画像検査や顕微鏡検査(病理検査)の診断報告 書の文章などや患者との対面で行われる診察中に記録するカルテ記載なども、担当医師がフリーテキ ストで入力することによって電子的蓄積が進み、その利用が活発になりつつある(下図は入力の例)。 こうした複雑な患者の状態が医学専門用語の組み合わせからなる文章で表現され蓄積されたテキス トリソースから、たとえば、ある特徴をもった患者情報を効率よく検索したり、長い診療経過の患者の状 態を短く要約したり、多数の患者データベースから共通の医学知識や相関ルールを抽出(テキストマイ ニングあるいは知識発見)したりするニーズが高まっているが、そのためにはいわゆる自然言語処理技 術と表裏一体としてh活用することが可能な専門用語の概念関係辞書が必須となっている。また、前述 のデータ利用の場面だけでなく、短い診療時間中、とりわけ患者と対面診療をしながら、効率よく患者 状態を専門用語の組み合わせでコンピュータに入力するには、きわめて洗練された文脈依存型の専 門用語入力インターフェイスの開発も必要不可欠であり、そのようなマンマシンインターフェイスの実現 のひとつとして、入力された専門用語から文脈空間を狭めそれに対応した適切な用語候補の提示など が望まれており、やはり医学用語の意味処理を可能とするための概念辞書の構築が望まれている。さ らに、患者の病状や症状を国際的な分類にコード化することも統計処理のためには重要であるが、そ のためにコーダーとよばれる分類コード化専門職による分類コーディング作業がなされてきた。しかし、 この作業は膨大なコストがかかるため多くの医療機関でかならずしも日常十分な精度で行われておら ず、全国規模の疫学調査(どのような疾患分類の患者がどの程度存在するかなどの調査)の精度と実 施頻度を著しく低下させている。こうしたコーディング作業を自動化するには、診断名や症状用語の組 み合わせが既存の分類体系のどこに対応するかを自動化することが必要で、やはり診断名や症状用 語の意味的な処理が必要になると同時に、分類体系のほうも意味処理が必要になる。このようなニー ズから、臨床医学分野での概念関係データベースともいえる臨床医学オントロジー構築とその活用へ の期待が高まりつつある。 2.臨床医学知識表現としてオントロジー 臨床医学の体系は、患者に観察される症状や検査結果の組み合わせから、患者を診断名(病名)とい われる分類し、その分類に応じて基本治療法を選択し、オプションとして症状や所見の組み合わせ状 況に応じて治療を追加もしくは修正はするという大きな枠組みから成り立っていると考えられる。また、 症状や検査結果の組み合わせから分類されていた診断概念に対して新たに出現した検査を適用する ことによってこれまで同一分類とみなしていた概念を分割したり、異なると考えられていた他の概念と組 み合わせて同一概念に整理されたりするために、概念間の関係が複雑化するのが特徴であり、この点 が人工物の概念整理と異なる点ではないかと考えている。 3.1 分類概念の時代変遷の取扱い ここでは、白血病の一種である急性リンパ性白血病(ALL: acute lymphocytic leukemia)を例にとって 一部を紹介する。 ◆急性リンパ性白血病(ALL)=白血球の一種であるリンパ球が未成熟な状態のままで異常増殖し、他 の正常な血液細胞が減少して、治療しないと数ヶ月以内で死亡する病気。 FAB分類:(1976~)= L1:一様の円型核とわずかな細胞質を有するリンパ芽球 L2:さらに多様なリンパ芽球;L1 よりも細胞質が多く核が不整である場合もある L

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