启动子区E-box以及周围CpG岛的甲基化与基因节律性表达的关系.pdfVIP

2011钲 12月 首 都 医 科 大 学 学 报 Dec．2011 第32卷 第6期 JournalofCapitalMedicalUniversity Vo1J32 No．6 [doi：10．3969／j．issn．1006-7795．2011．06．015] ·帕 金 森 病 的 发 病 机 制 研 究 · 启动子区E-bOX以及周围CpG岛的甲基化与 基因节律性表达的关系 左晓虹 刘 妹 林庆玲 李 宁 陈 彪 蔡彦宁 (首都医科大学宣武医院神经生物学研究室 ，教育部神经变性病重点实验室 北京 100053) 【摘要】 目的 探讨m r2、mCryl和mDBP启动子区E—box以及周围CpG岛的甲基化是否影响E—box和 BMAL1／CLOCK基因和 蛋白相互作用的方式；以及启动子区的甲基化状态是否影响MAP激酶磷酸化酶 1(MAPkinasephosphatise1，MKP1)的组织特异性 表达调控。方法 分6个时间点取C57BL／6J小鼠的肝脏和肾脏，提取DNA，通过重硫酸盐处理基因组DNA，以及测序检测E—box 和周围CpG岛的甲基化状态。结果 roPer2、mCryl和mDBP启动子区E—box以及周围CpG岛无明显甲基化状态 ，肝脏和。肾脏中 MKP1的E—box以及周围CpG岛亦无明显甲基化状态。结论 节律基因的启动子区E—box以及周围CpG岛的甲基化不参与节律基 因表达的日节律性调控。 【关键词】 时钟基因；E—box；CpG岛；DNA甲基化 【中图分类号】 Q751 Circadian E—boxes and surrounding CpG islands are free from methylation throughouttheday ZUOXiao—hong，LIUShu，LINQing—ling，LINing，CHENBiao，CAIYah—ning (DepartmentofNeurobiology，XuanwuHospital，CapitalMedicalUniversity；KeyLaboratoryofNeurodegenerativeDiseases， MinistryofEducation，Betling100053，China) A【bstract】 Objective TostudytheDNAmethylationofE—boxeswhichmayormaynotbeinvolvedintheprotein／DNAinteracting andintheMKP1tissue—specificexpressions．TostudytheDNA meth)lationofE-boxeswhichmayornotinvolvedintheprotein／DNA interactingandintheMKP1tissue—specificexpressions．Methods C57BL／6Jmalemicewererandomizedinto6groupsandwere sacrificedatsixdifferenttimepointsduringa24一hourperiod．Liverandkidneywereisolated．GenomieDNA wasextractedandDNA methylationwasexaminedusingbisulfitesequencinganalysis．Results AllE—boxesandtheirsurroundingCpG islandswerefreefrom methylation．ThemethylationstatusoftheE．boxintheMKP1promoterindifierenttissueswasalsonegative．Conclusion 0urresults indicatedthatDNA methylationdoesnotdeterminedistinctbindingfeaturesofcircadiangenesandalsodoesnotregulatethetissuespecific clockcontrolofMKP1． 【Keywords】 clockgene；E—box；CpGisland；DNAmethylation