动物遗传育种分子生物学试验室赵明2010年12月10日-农业生物信息.PDF

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动物遗传育种分子生物学试验室赵明2010年12月10日-农业生物信息

动物遗传育种分子生物学实验室 赵明 2010年12月10日 • 表型组学的概念和产生背景 1 • 重要研究机构 • 主要刊物 2 • 经典论文(研究案例) • 重要前沿课题(尚待解决的问题) 3  表型 (Phenotypes) 又称表现型,对于一个 生物而言,表示它某一 特定的物理外观或成分。 例如一个人是否有耳珠、 植物的高度、人的血型、 蛾的颜色。 贝壳的不同纹理  表型主要受生物的基因型和环 境影响。  表型可分为连续变异或不连续 变异的。前者较易受环境因素 影响,基因型上则会受多个等 位基因影响,如体重、智力和 身高;后者仅受几个等位基因 影响,而且很少会被环境改变, 如血型、眼睛颜色和卷舌的能 力。 表型由微观到宏观还可以分为细胞表型、组织 表型、器官表型以及整体表型。  表型组:在遗传和环境因素的影响下,生 物体表现型主要信息的集合。( Varki , Altheide,2005 )  生物体在细胞、组织、器官、生物体或种 属水平上表现出的所有表型的组合。(维 基百科)  自20 世纪90 年代初以来,生命科学领域出现 了最为引人注目的“组学(omics)”新概念 和新学科,如基因组学 (genomics)、转录组 (transcriptomics)、蛋白质组学(proteomics) 和代谢组学 (metabolomics)等。伴随各种“组 学”的不断兴起和发展,90 年代末,人们提 出了表型组(phenome)和表型组学 (phenomics) 的概念。  1996 年,衰老研究中心 (The Aging Research Centre (ARC))主任Steven A. Garan 在加拿 大滑铁卢大学的客座演讲中首次提出 “phenomics”这一概念。  表型组学是联系表现型与基因型的桥梁,并以一体化的形式联系着遗传学与 功能基因组学。( Kelsoe and Niculescu ,2002)  表型组学是一门在基因组水平上系统研究表型的学科。(Bilder ,2009)  从表型组角度而言,表型组学是一个与表型鉴定研究相关的领域,并结合基 因(基因组)或蛋白(蛋白组)的研究来探究表型的本质及它们之间的相互作用 关系的学科。(维基百科)  表型组学可定义为一门在基因组水平上系统研究某一生物或细胞在各种不同 环境条件下所有表型的学科。  表型组学是系统生物学组学平台的终端,通过基因组学、转录组学、蛋白质 组学、代谢组学、互作组学到表型组学完成了由基因序列到基本生命活动的 全过程。(杨胜利) 表型组学主要的研究机构及其网址 机构名称 网址 CropDesign corporation /general.ph p The Australian Plant Phenomics .au/ Facility (APPE) The Plant Phenomics Platform /scanalyzer_g h.htm The Laboratory of Neurophenomics /index .php UCLA Consortium for Neuropsychiatric / Phenomics The Aging Research Centre (ARC) / Australian Phenomics Facility

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