应用PCR-DGGE和Q-PCR分析不同体重斑点叉尾皮肤-中国水产科学.PDFVIP

中国水产科学 2017 年 1 月, 24(1): 156164 Journal of Fishery Sciences of China 研究论文 DOI: 10.3724/SP.J.1118.2017.15480 应用PCR-DGGE 和Q-PCR 分析不同体重斑点叉尾 皮肤、鳃和 胃肠道菌群结构 1, 3 2 1 1 1 孙豪 , 时云朵, 倪学勤 , 刘倩, 曾东 1. 四川农业大学 动物医学院, 四川 成都 611130; 2. 四川省水产学校, 四川 成都 611730; 3. 雅安市农业局, 四川 雅安 625000 摘要: 采用聚合酶链式反应−变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和荧光定量−聚合酶链式反应(Q-PCR)技术分析高体 重(high weight, HW)和低体重(low weight, LW)斑点叉尾 (Ietalurus punetaus)皮肤、鳃和胃肠道菌群多样性, 为斑 点叉尾 微生态研究及筛选斑点叉尾 源益生菌提供理论依据。结果显示, 斑点叉尾 菌群丰富度由低到高依次为 鳃、皮肤、前肠、后肠和胃。肠杆菌科(Enterobacteriaceae)和气单胞菌属(Aeromonas )是皮肤的优势菌群; 肠杆菌科 (Enterobacteriaceae) 、气单胞菌属(Aeromonas ) 和肠球菌属(Enterococcus)是水体、鳃和胃的优势菌群; 肠杆菌科 (Enterobacteriaceae) 、拟杆菌属(Bacteroidetes) 、气单胞菌属(Aeromonas )和酵母菌属(Saccharomyces)是肠道的优势菌 群。HW 斑点叉尾 鳃菌群的香农多样性指数、均匀度和丰富度及前肠菌群的丰富度显著高于 LW 斑点叉尾 P0.05 。皮肤的黄杆菌属(Flavobacterium), 胃的肠杆菌科(Enterobacteriaceae), 前肠的拟杆菌属(Bacteroidetes)和双 ( ) 歧杆菌属(Bifidobacterium)及后肠的拟杆菌属(Bacteroidetes) 、双歧杆菌属(Bifidobacterium) 和酵母菌属(Saccharo- 1.97 7.69 6.19 3.83 6.13 3.92 4.26 myces) 的拷贝数分别是 10 、10 、10 、10 、10 、10 和 10 , 均显著高于LW 斑点叉尾 (P0.05) 。 结果表明, 斑点叉尾 皮肤、鳃、胃肠道均形成独特的菌群结构, LW 和HW 斑点叉尾 菌群结构存在明显差异, HW 斑点叉尾 菌群多样性增加。 关键词: 斑点叉尾 ; PCR-DGGE; Q-PCR; 皮肤菌群; 鳃菌群; 肠道菌群 中图分类号: S941 文献标志码: A 文章编号: 10058737(2017)01015609 斑点叉尾 (Ietalurus punetaus)原产于美洲, 业的可持续发展。宿主正常菌群是益生菌的主要 是全世界公认的适合淡水养殖的优良品种。1984 来源。目前, 渔业动物正常微生物的研究多在胃 年湖北省水产研究所首次从美国引进该物种, 通 肠道, 且大多采用活菌培养法, Luo 等[5]用平板培 过多年的试养与推广, 已成为中国普遍养殖的一 养法筛选出斑点叉尾 源枯草芽孢杆菌 BHl344, 种重要经济鱼类, 但在斑点叉尾 规模化养殖中, 但未对其菌群结构进行研究; 而对鱼类鳃和皮肤 暴发性死亡时有发生, 严重影响其产量和经济效 的微生态, 以及比较分析不同体重鱼类的微生态 益[1] 。目前, 对鱼类疾病的防治主要是用抗生素类 的研究较少。此外,