药物基因组学相关数据库.docVIP

药物基因组学数据库 Drugbank http://www.drugbank.ca/ 2、dgidb / pharmGKB / 4、cancercommon / 5、ChEMBL https://www.ebi.ac.uk/chembldb/ 6、mycancergenome / 7、TTD .sg/group/cjttd/ 8、guidetopharmcology / 9、clearityfoundation / CIViC /#/home DoCM / 1 Drugbank 药物和药物靶标资源库。DrugBank是一个独特的生物信息学/化学信息学资源，它结合了详细的药物（例如化学制品）数据和综合的药物靶点（即：蛋白质）信息。该数据库包含了超过4100个药物条目，包括超过800个FDA认可的小分子和生物技术药物，以及超过3200个试验性药物。此外，超过1.4万条蛋白质或药物靶序列被链接到这些药物条目。每个DrugCard条目包含超过80个数据域，其中一半信息致力于药物/化学制品数据，另一半致力于药物靶点和蛋白质数据。许多数据域超链接到其他数据库（KEGG、PubChem、ChEBI、Swiss-Prot和GenBank）和各种结构查看小应用程序。该数据库是完全可搜索的，支持大量的文本、序列、化学结构和关系查询搜索。DrugBank的潜在应用包括模拟药物靶点发现、药物设计、药物对接或筛选、药物代谢预测、药物相互作用预测和普通药学教育。DrugBank可以在http://www.drugbank.ca使用???Browse按钮：Drug Browse、Category Browse、Geno Browse、Reaction Browse、Pathway Browse、Class Browse、Target Browse； （2）???Search按钮：ChemQuery Structure Search、Interax Interaction Search、Sequence Search、Advanced Search、MS Search、MS/MS Search、GC/MS Search、1D NMR Search、2D NMR Search； （3）???其他Tool按钮：HMDB、T3DB、SMPDB、FooDB、PPT-DB、CSF、Serum Metabolome、CCDB、YMDB、BMDB、ECMDB、MarkerDB、BacMap、Ref-DB。 Drug Browse： 小分子药物、生物技术药物、显示药物在DrugBank中的ID、药物名称、分子量、化学式、化学结构、药物类型、治疗症状。 Drugs：显示ID、药物名称、治疗疾病 Drugs and Targets：显示ID、药物名称、作用位点（靶标）、靶标类型 总结：可以查找药物名称、分子量、化学式、分子结构、药物所属类型、靶标、靶标类型、治疗疾病、代谢途径等，还可链接到相关网站。（较实用） Drug Browse：药名、分子量、化学式、化学结构、药物分类、药效 Geno Browse：药物名称，相互作用的基因/酶，SNP位点、等位基因名称、碱基变化、副作用 Pathway Browse：可查看代谢通路 Classification Browse：药物分类 Target Browse：查靶标及靶标分类和详细细节（药物分类、药理学等） 2 ChEMBL 生物活性药物类小分子数据库。 总结：输入分子结构或已知靶标描述或靶标蛋白，每条记录都包括分子的分类、名称、ChEMBI?ID、功能、毒性、亚细胞定位、结构、序列、参考文献等。（偏向于化学） 3 clearityfoundation 关于卵巢癌的公益网站。治疗卵巢癌复发有关肿瘤分子信息临床试验卵巢癌诊断和治疗分析新型靶向制剂的临床开发治疗结果。 4 DoCM 位点突变数据库， 总结：查找染色体、基因、疾病、突变类型、氨基酸、起始位置、参考文献（稍微简单了点） 5 CIViC Search：查找描述、疾病名称、疾病DOID、药物PubChem ID、药物名称、 证据水平、基因名、PubChem ID、突变位点等查找相关信息。 总结：evidence ID、基因、氨基酸变化、描述、病名、药物、evidence level（A：经过验证的；B：临床；C：临床前；D：个体研究；E：推理的）、evidence type (predictive、diagnostic、prognostic）、evidence direction(supports、dose not support)、clinical significance(sensitivice/resistance or non-response/better o