玉米基因组全长cDNA序列获得的辅助策略及其效用评价.pdfVIP

● C T - O日RICULTUR4E 华北农学报·2008，23(增刊)：19．22 帅RE叫-S洲聃 玉米基因组全长cDNA序列获得的辅助 策略及其效用评价 王益军，邓德祥，卞云龙 (扬州大学农学院。江苏扬州225009) 摘要：以玉米DNA拓扑异构酶I基因聊J的克隆为例，发展了获得玉米基因组全长cDNA序列的3种辅助策略： 逐步展示法、保守结构域策略和BAC途径，并对这3种策略的效用进行了评价。 关键词：玉米；全长cDNA；辅助策略 中图分类号：S513．03文献标识码：A文章编号：1000—7091(2008)增刊一19一04 Acc骼sorialMethodst0AchieVeFIlll cDNA in Length Sequence MaizeGenomeandTheirEffectivenessEvaluation WANG Yi-jun，DENGDe一】【iang，BIANYun-long of 225009，China) (CollegeAgro栅1y，YangzhouUnive璐ity，Yangzllou maize methodsdevel一 觚咖ct：TakeDNA I acces∞rial Topoi∞merasegene脚Jcloning鹊蚰ex啪ple，tIlree fuU cDNA in眦ize were by dominstmt— 叩edfor∞hievinglen昏h sequence genome，thatstepstepappmach，coTlseⅣed BAC descr：ibed．ThetIlreeaccessorialmethodswerealso够sessedinthis eg：)，mld technique，were pri眦rily study． method Keywords：Maize；FuUlengthcDNA；Accessorial 功能基因组学是以相互联系的观点将基因纳入 组较为复杂的生物，如玉米、小麦基因组学研究的关 生物体物质和能量代谢的网络系统，在基因组整体 键点所在。 水平上对基因的活动规律进行解析。功能基因组学 本研究以玉米DNA拓扑异构酶I基因脚J的 研究中，目的基因全长cDNA序列的获得是基因功克隆为实例，发展了获得目的基因全长cDNA序列 能得以成功挖掘的基础。全长cDNA序列的获得可的3种辅助策略：逐步展示法、保守结构域策略和 以通过多种途径：数据库检索、cDNA文库筛选和BAc途径，并对这3种策略的效用进行了评价，旨在 cDNA end)反应等。拟南为其他物种的基因组学研究提供参考。 RACE(Rapid啪plificati伽0f 芥、水稻等模式生物全基因组序列已经测定u。3J，因 1 材料和方法 此这些物种可咨借鉴的信息较为丰富，一般通过数 据库检索等途径就能获得目的基因的全长cDNA序1．1供试材料 列。其他一些物种，如玉米、小麦的基因组较大、较 玉米自交系M017由河南农业大学汤继华教授 复杂，而且全基因组测序工作尚未完成。这些物种，