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2011高级生化大作业二
2011高级生化大作业 二
姓名： 江建军 专业： 遗传学 学号： 2011218104
（选做一题或二题，PPT或Word格式，请发450889@邮箱）
一、有机小分子下载及计算绘图
使用DNP (Dictionary of Natural Products)
/dictionary-search.do?method=freeView
或eMolecules
/
查询并下载分子4个，用ChemOffice或其他做图，并截图。另，建议操练直接使用ChemDraw绘制结构并做能量优化。（相关软件因版权问题请自行查找）
二 蛋白质结构模拟及structure visualization
1. 分别到NCBI （/）、UniProt （/）
以任选关键词完成两次结果搜索，下载序列
NCBI：
2. 到/ 进行序列比对。注意选择程序为Protein blast (即blastp)
然后数据库选择PDB （并尝试其他数据库）
进行序列比对，确保无100% identity结构，然后进行结构模建及绘图。
可选择：
/ 或 / 或其他服务器
3. 熟练运用一款分子做图软件，可以是Rasmol（Raswin）、Swiss PDB Viewer或ICM Browser对建模的蛋白绘图，要求在一个蛋白分子分别展示三种以上绘图方式。
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